43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2784 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2784  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  197  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6610  PRC-barrel domain protein  77.55 
 
 		 98 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.106197 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3101  PRC-barrel  38 
 
 		 400 aa  77  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2065  PRC protein  31.87 
 
 		 285 aa  60.8  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1252  PRC-barrel domain-containing protein  39.02 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.864709  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1212  PRC-barrel domain-containing protein  36.05 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  0.163057 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1610  hypothetical protein  35.63 
 
 		 280 aa  57.4  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1662  hypothetical protein  35.63 
 
 		 280 aa  57.4  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2674  hypothetical protein  36.05 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.733885  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3424  PRC-barrel domain-containing protein  42.86 
 
 		 250 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39453  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1331  PRC-barrel domain-containing protein  36.05 
 
 		 189 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2027  PRC-barrel domain-containing protein  38.46 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0433  PRC-barrel domain-containing protein  35 
 
 		 212 aa  50.8  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173009  normal  0.857282 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1132  PRC-barrel containing protein  50 
 
 		 294 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0542  PRC-barrel domain protein  33.75 
 
 		 201 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0499  PRC-barrel domain protein  33.75 
 
 		 201 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.484465 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2130  PRC-barrel domain-containing protein  41.98 
 
 		 196 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3869  hypothetical protein  34.33 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.591941 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2697  PRC-barrel  35.56 
 
 		 300 aa  45.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.289885  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3337  PRC-barrel domain-containing protein  34.69 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3564  PRC-barrel domain-containing protein  38.64 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.589569 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0920  PRC-barrel  35.8 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4622  PRC-barrel domain-containing protein  33.67 
 
 		 142 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670971 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1003  PRC-barrel domain-containing protein  37.5 
 
 		 147 aa  44.3  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5606  PRC-barrel domain-containing protein  33.67 
 
 		 142 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.958862  normal  0.410913 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5253  PRC-barrel  33.67 
 
 		 142 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4658  PRC-barrel protein  37.04 
 
 		 292 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1144  PRC-barrel  31.25 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.016878 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0812  photosynthetic reaction center protein  34.57 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.212704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3831  PRC-barrel domain protein  34 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2897  hypothetical protein  30.1 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.020112 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0088  hypothetical protein  33.67 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2428  hypothetical protein  36.67 
 
 		 137 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4152  PRC-barrel  34.04 
 
 		 133 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1321  hypothetical protein  36.59 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0470911  normal  0.0599346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2854  PRC-barrel domain-containing protein  43.4 
 
 		 214 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.813068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3233  PRC-barrel domain-containing protein  32.32 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3080  PRC-barrel domain protein  43.4 
 
 		 214 aa  40.4  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4102  PRC-barrel  31.4 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997072  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5290  PRC-barrel domain protein  36.59 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6545  PRC-barrel domain-containing protein  32.56 
 
 		 170 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.679838  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4630  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 167 aa  40  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0944476 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4890  PRC-barrel  33.33 
 
 		 120 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>