77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6610 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6610  PRC-barrel domain protein  100 
 
 		 98 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.106197 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2784  hypothetical protein  77.55 
 
 		 98 aa  162  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3101  PRC-barrel  39.8 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1252  PRC-barrel domain-containing protein  43.9 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.864709  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1662  hypothetical protein  36.96 
 
 		 280 aa  65.1  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1610  hypothetical protein  36.96 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2065  PRC protein  36.36 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1212  PRC-barrel domain-containing protein  37.21 
 
 		 213 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  0.163057 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2027  PRC-barrel domain-containing protein  40.51 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2674  hypothetical protein  36.05 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.733885  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0542  PRC-barrel domain protein  33.71 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1331  PRC-barrel domain-containing protein  37.04 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0499  PRC-barrel domain protein  33.71 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.484465 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0433  PRC-barrel domain-containing protein  37.5 
 
 		 212 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173009  normal  0.857282 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3424  PRC-barrel domain-containing protein  44.16 
 
 		 250 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39453  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1132  PRC-barrel containing protein  44.64 
 
 		 294 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3869  hypothetical protein  38.89 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.591941 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6545  PRC-barrel domain-containing protein  35.63 
 
 		 170 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.679838  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3564  PRC-barrel domain-containing protein  39.76 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.589569 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2697  PRC-barrel  37.04 
 
 		 300 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.289885  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3337  PRC-barrel domain-containing protein  35.8 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1003  PRC-barrel domain-containing protein  34.09 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0915  hypothetical protein  41.79 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0812  photosynthetic reaction center protein  34.57 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.212704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0088  hypothetical protein  34.69 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1989  PRC-barrel domain protein  34.57 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2897  hypothetical protein  30.77 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.020112 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5606  PRC-barrel domain-containing protein  33.67 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.958862  normal  0.410913 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4622  PRC-barrel domain-containing protein  33.67 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670971 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5253  PRC-barrel  33.67 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1049  PRC-barrel domain protein  31.25 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.340266 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4102  PRC-barrel  34.88 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997072  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0920  PRC-barrel  34.57 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2428  hypothetical protein  35.9 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3233  PRC-barrel domain-containing protein  33.67 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5290  PRC-barrel domain protein  34.15 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1971  PRC-barrel domain-containing protein  32.1 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5435  PRC-barrel domain-containing protein  35.44 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4656  PRC-barrel domain protein  34.18 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.965669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4152  PRC-barrel  37.04 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4658  PRC-barrel protein  37.97 
 
 		 292 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0549  hypothetical protein  31.76 
 
 		 130 aa  43.5  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4133  PRC-barrel domain protein  34.69 
 
 		 143 aa  42.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3831  PRC-barrel domain protein  37.04 
 
 		 169 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4630  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0944476 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0805  PRC-barrel domain protein  33.73 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123295 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0145  PRC-barrel domain protein  33.73 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2784  hypothetical protein  36.21 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.146377 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1321  hypothetical protein  31.71 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0470911  normal  0.0599346 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2461  hypothetical protein  30 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.389117 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0559  hypothetical protein  35.71 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4890  PRC-barrel  33.33 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4885  PRC-barrel domain-containing protein  35.44 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330906  normal  0.110726 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3853  PRC-barrel  34.74 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0139  PRC-barrel domain protein  33.73 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.130291 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5649  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2130  PRC-barrel domain-containing protein  40.51 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3794  PRC-barrel  36.25 
 
 		 120 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.182164  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1144  PRC-barrel  28.75 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.016878 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5241  PRC-barrel domain protein  33.33 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2361  PRC-barrel  32.91 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.000190048  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0930  hypothetical protein  32.91 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.326505  normal  0.347558 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2854  PRC-barrel domain-containing protein  47.06 
 
 		 214 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.813068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3141  PRC-barrel domain-containing protein  32.95 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719915  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3012  PRC-barrel domain-containing protein  32.95 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0907577  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1361  PRC-barrel domain-containing protein  32.95 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3080  PRC-barrel domain protein  45.28 
 
 		 214 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4129  PRC-barrel  29.29 
 
 		 140 aa  40.4  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.674584  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4087  PRC-barrel domain protein  28.46 
 
 		 179 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2822  PRC-barrel domain-containing protein  30 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1343  PRC-barrel protein  38.89 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5914  PRC-barrel  32.43 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73719  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3464  PRC-barrel domain protein  30 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5446  PRC-barrel domain protein  31.82 
 
 		 175 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1454  hypothetical protein  32.5 
 
 		 288 aa  40.4  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649644  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4137  PRC-barrel domain-containing protein  32.91 
 
 		 129 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0140629 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0995  PRC-barrel domain-containing protein  35.94 
 
 		 132 aa  40  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123984  normal  0.267939 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>