93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0559 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0559  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  294  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4133  PRC-barrel domain protein  95.8 
 
 		 143 aa  286  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4656  PRC-barrel domain protein  56.1 
 
 		 141 aa  154  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.965669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5435  PRC-barrel domain-containing protein  51.09 
 
 		 142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0930  hypothetical protein  54.47 
 
 		 141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.326505  normal  0.347558 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4885  PRC-barrel domain-containing protein  51.09 
 
 		 142 aa  150  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330906  normal  0.110726 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3233  PRC-barrel domain-containing protein  51.2 
 
 		 142 aa  140  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0088  hypothetical protein  52 
 
 		 142 aa  140  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5606  PRC-barrel domain-containing protein  51.2 
 
 		 142 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.958862  normal  0.410913 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4622  PRC-barrel domain-containing protein  51.2 
 
 		 142 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670971 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5253  PRC-barrel  51.2 
 
 		 142 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5489  hypothetical protein  42.75 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.240077 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2373  hypothetical protein  40.85 
 
 		 145 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.662608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3691  hypothetical protein  41.55 
 
 		 146 aa  121  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6894  hypothetical protein  47.12 
 
 		 111 aa  120  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4398  PRC-barrel domain-containing protein  46.85 
 
 		 135 aa  116  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3337  PRC-barrel domain-containing protein  53.77 
 
 		 140 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1802  PRC-barrel domain protein  42.06 
 
 		 136 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2126  PRC-barrel domain protein  42.86 
 
 		 136 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0283705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5914  PRC-barrel  47.17 
 
 		 140 aa  100  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73719  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3564  PRC-barrel domain-containing protein  44.64 
 
 		 137 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.589569 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0549  hypothetical protein  49.33 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1321  hypothetical protein  42.31 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0470911  normal  0.0599346 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5290  PRC-barrel domain protein  43.24 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1301  PRC-barrel domain protein  38.82 
 
 		 163 aa  70.1  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4129  PRC-barrel  33.33 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.674584  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0499  PRC-barrel domain protein  35.56 
 
 		 201 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.484465 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0542  PRC-barrel domain protein  35.56 
 
 		 201 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2897  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.020112 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3424  PRC-barrel domain-containing protein  32.31 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39453  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3831  PRC-barrel domain protein  37.35 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2461  hypothetical protein  48.08 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.389117 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0263  PRC-barrel domain-containing protein  45.21 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1662  hypothetical protein  36.05 
 
 		 280 aa  54.3  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1610  hypothetical protein  36.05 
 
 		 280 aa  54.3  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2888  PRC-barrel  46.15 
 
 		 174 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22527  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3743  PRC-barrel domain protein  46.99 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0433  PRC-barrel domain-containing protein  36.84 
 
 		 212 aa  51.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173009  normal  0.857282 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6545  PRC-barrel domain-containing protein  34.02 
 
 		 170 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.679838  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5649  PRC-barrel domain-containing protein  35.29 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1049  PRC-barrel domain protein  30.72 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.340266 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2065  PRC protein  31.58 
 
 		 285 aa  50.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3101  PRC-barrel  34.94 
 
 		 400 aa  50.8  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2130  PRC-barrel domain-containing protein  38.89 
 
 		 196 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2027  PRC-barrel domain-containing protein  37.5 
 
 		 172 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3502  PRC-barrel domain protein  38.46 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.002233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4087  PRC-barrel domain protein  31.19 
 
 		 179 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4918  PRC-barrel  36.25 
 
 		 173 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1212  PRC-barrel domain-containing protein  33.77 
 
 		 213 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  0.163057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2167  PRC-barrel  36.23 
 
 		 187 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492056  normal  0.548798 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1252  PRC-barrel domain-containing protein  35.29 
 
 		 284 aa  47.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.864709  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1923  PRC-barrel  32.22 
 
 		 183 aa  47.8  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3869  hypothetical protein  31.18 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.591941 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0078  PRC-barrel domain protein  33.33 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.559393 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1513  PRC-barrel  33.75 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.273224  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4630  PRC-barrel domain-containing protein  35.23 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0944476 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0070  PRC-barrel domain protein  33.33 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1003  PRC-barrel domain-containing protein  31.82 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0390  PRC-barrel domain-containing protein  33 
 
 		 526 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5072  PRC-barrel  36.49 
 
 		 163 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.808195  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5718  PRC-barrel domain-containing protein  31.58 
 
 		 231 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099038  hitchhiker  0.00405289 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1132  PRC-barrel containing protein  38.18 
 
 		 294 aa  44.3  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0200  PRC-barrel  32.5 
 
 		 171 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2972  PRC-barrel domain protein  31.58 
 
 		 214 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.42341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3426  PRC-barrel  40.35 
 
 		 178 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6610  PRC-barrel domain protein  35.71 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.106197 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2674  hypothetical protein  29.27 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.733885  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1389  PRC-barrel domain protein  27.81 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1331  PRC-barrel domain-containing protein  29.27 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3192  PRC-barrel domain-containing protein  30.1 
 
 		 212 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2854  PRC-barrel domain-containing protein  34.48 
 
 		 214 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.813068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4152  PRC-barrel  32.22 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1963  photosynthetic reaction center protein  40 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0812  photosynthetic reaction center protein  35.56 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.212704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1454  hypothetical protein  28.57 
 
 		 288 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649644  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3080  PRC-barrel domain protein  34.48 
 
 		 214 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0486  hypothetical protein  31.25 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.299325  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1277  PRC-barrel domain protein  38.89 
 
 		 260 aa  41.6  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.244172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0915  hypothetical protein  37.66 
 
 		 177 aa  41.6  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0329  PRC-barrel  28.95 
 
 		 274 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1971  PRC-barrel domain-containing protein  32.89 
 
 		 118 aa  41.2  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2302  hypothetical protein  37.93 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075687 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  31.65 
 
 		 234 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2262  hypothetical protein  31.58 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.260475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2570  hypothetical protein  33.8 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.53444e-20  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4890  PRC-barrel  34.07 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1648  PRC-barrel domain-containing protein  39.02 
 
 		 220 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1267  PRC-barrel domain protein  34.62 
 
 		 211 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3828  hypothetical protein  31.25 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0929  PRC-barrel domain-containing protein  27.96 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13635  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1989  PRC-barrel domain protein  35.37 
 
 		 112 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2103  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 158 aa  40  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3212  PRC-barrel  27.59 
 
 		 193 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.658486  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>