91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2103 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2103  PRC-barrel domain-containing protein  100 
 
 		 158 aa  318  3e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0389  PRC-barrel domain-containing protein  58.17 
 
 		 399 aa  179  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0390  PRC-barrel domain-containing protein  44.12 
 
 		 526 aa  104  6e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0929  PRC-barrel domain-containing protein  46.24 
 
 		 122 aa  91.3  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13635  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1923  PRC-barrel  36.57 
 
 		 183 aa  88.6  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0200  PRC-barrel  36.67 
 
 		 171 aa  86.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1539  hypothetical protein  38.1 
 
 		 485 aa  86.3  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0486  hypothetical protein  41.05 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.299325  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5072  PRC-barrel  41.41 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.808195  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2302  hypothetical protein  38.95 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075687 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0078  PRC-barrel domain protein  38.94 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.559393 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2262  hypothetical protein  44.09 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.260475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0070  PRC-barrel domain protein  40 
 
 		 156 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4218  PRC-barrel domain protein  38.3 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5446  PRC-barrel domain protein  36.36 
 
 		 175 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1768  PRC-barrel domain-containing protein  39.78 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1538  hypothetical protein  37.78 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1513  PRC-barrel  38.78 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.273224  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3579  PRC-barrel domain-containing protein  38.71 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.632038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1971  PRC-barrel domain-containing protein  35.48 
 
 		 118 aa  72  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4945  hypothetical protein  33.04 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0731378  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1160  hypothetical protein  35.35 
 
 		 175 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6353  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6470  PRC-barrel domain-containing protein  35.48 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00723922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5622  PRC-barrel domain-containing protein  35.48 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1359  PRC-barrel  35.48 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.73253  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6059  PRC-barrel domain-containing protein  35.48 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.185683 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5464  PRC-barrel domain-containing protein  36.56 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4240  PRC-barrel domain-containing protein  33.64 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1361  PRC-barrel domain-containing protein  31.54 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4260  PRC-barrel domain-containing protein  32.26 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.232503 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6586  PRC-barrel domain protein  34.41 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000000440037  normal  0.0354416 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3012  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0907577  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3141  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719915  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3795  PRC-barrel domain-containing protein  32.26 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2570  hypothetical protein  35.48 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.53444e-20  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5293  PRC-barrel domain-containing protein  35.48 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.15156 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4918  PRC-barrel  34.41 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5974  PRC-barrel domain-containing protein  32.73 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4381  PRC-barrel domain-containing protein  34.41 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206882  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3986  PRC-barrel  34.41 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766762  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1790  PRC-barrel domain-containing protein  31.58 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.981304  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1690  PRC-barrel domain-containing protein  31.18 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  33.7 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1989  PRC-barrel domain protein  33.33 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5672  PRC-barrel domain protein  28.57 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1638  hypothetical protein  29.79 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900069  normal  0.195794 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3828  hypothetical protein  29.7 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1396  PRC-barrel  29.25 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3502  PRC-barrel domain protein  29.89 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.002233 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5289  PRC-barrel  31 
 
 		 142 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.928377  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5569  PRC-barrel domain-containing protein  31 
 
 		 142 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2333  hypothetical protein  28.72 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.16959  normal  0.0255916 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1587  PRC-barrel domain-containing protein  31.71 
 
 		 119 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1316  PRC-barrel domain protein  33.71 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976988  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0805  PRC-barrel domain protein  26.6 
 
 		 125 aa  50.8  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123295 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0145  PRC-barrel domain protein  28.57 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4137  PRC-barrel domain-containing protein  24.71 
 
 		 129 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0140629 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0139  PRC-barrel domain protein  28.57 
 
 		 130 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.130291 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3285  PRC-barrel domain-containing protein  29.27 
 
 		 131 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1002  PRC-barrel domain-containing protein  35.8 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.898578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3485  PRC-barrel domain protein  30.49 
 
 		 135 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.999892  normal  0.263816 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2338  hypothetical protein  29.63 
 
 		 120 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.538206  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1014  PRC-barrel domain-containing protein  29.63 
 
 		 120 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3608  PRC-barrel domain protein  29.27 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.30312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4658  PRC-barrel protein  30.1 
 
 		 292 aa  48.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3869  hypothetical protein  34.48 
 
 		 157 aa  48.5  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.591941 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2876  PRC-barrel domain-containing protein  26.83 
 
 		 122 aa  47.8  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4517  PRC-barrel domain-containing protein  25.61 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0995  PRC-barrel domain-containing protein  28.95 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123984  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0931  PRC-barrel domain-containing protein  29.27 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0930  hypothetical protein  31.71 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.326505  normal  0.347558 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3019  PRC-barrel domain-containing protein  27.62 
 
 		 127 aa  44.7  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3464  PRC-barrel domain protein  29.41 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3126  PRC-barrel domain-containing protein  28.05 
 
 		 173 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.201028 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1128  PRC-barrel domain-containing protein  34.67 
 
 		 389 aa  43.9  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3101  PRC-barrel  23.53 
 
 		 400 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4622  PRC-barrel domain-containing protein  31.03 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670971 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4656  PRC-barrel domain protein  32.93 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.965669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3447  PRC-barrel domain protein  28.05 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5253  PRC-barrel  31.03 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5606  PRC-barrel domain-containing protein  31.03 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.958862  normal  0.410913 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3323  PRC-barrel domain protein  28.05 
 
 		 146 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2674  hypothetical protein  38.03 
 
 		 115 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.733885  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3233  PRC-barrel domain-containing protein  35.14 
 
 		 142 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0474  PRC-barrel domain-containing protein  23.23 
 
 		 142 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903154  hitchhiker  0.00309714 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1331  PRC-barrel domain-containing protein  38.03 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4152  PRC-barrel  21.84 
 
 		 133 aa  41.2  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2130  PRC-barrel domain-containing protein  27.78 
 
 		 196 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2822  PRC-barrel domain-containing protein  27.38 
 
 		 122 aa  40.8  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1252  PRC-barrel domain-containing protein  27.97 
 
 		 284 aa  40.8  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.864709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>