100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2333 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2333  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  253  6e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.16959  normal  0.0255916 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1539  hypothetical protein  44.14 
 
 		 485 aa  95.9  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1538  hypothetical protein  42.86 
 
 		 271 aa  94  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2570  hypothetical protein  38.18 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.53444e-20  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5072  PRC-barrel  38.33 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.808195  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0070  PRC-barrel domain protein  34.82 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1768  PRC-barrel domain-containing protein  36.36 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0486  hypothetical protein  34.26 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.299325  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0078  PRC-barrel domain protein  34.55 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.559393 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5446  PRC-barrel domain protein  34.26 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4945  hypothetical protein  38.53 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0731378  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5293  PRC-barrel domain-containing protein  35.19 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.15156 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1160  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1690  PRC-barrel domain-containing protein  33.64 
 
 		 156 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6586  PRC-barrel domain protein  33.64 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000000440037  normal  0.0354416 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0929  PRC-barrel domain-containing protein  34.48 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13635  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4218  PRC-barrel domain protein  33.63 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5622  PRC-barrel domain-containing protein  34.55 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6353  PRC-barrel domain-containing protein  34.55 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1923  PRC-barrel  40.7 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2302  hypothetical protein  36.56 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075687 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3795  PRC-barrel domain-containing protein  30.91 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2262  hypothetical protein  31.53 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.260475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5464  PRC-barrel domain-containing protein  32.73 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4260  PRC-barrel domain-containing protein  30.91 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.232503 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1513  PRC-barrel  39.81 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.273224  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6059  PRC-barrel domain-containing protein  33.64 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.185683 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6470  PRC-barrel domain-containing protein  33.64 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00723922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1359  PRC-barrel  33.64 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.73253  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4918  PRC-barrel  35.14 
 
 		 173 aa  67.8  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3012  PRC-barrel domain-containing protein  32.11 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0907577  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3141  PRC-barrel domain-containing protein  32.11 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719915  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1361  PRC-barrel domain-containing protein  32.11 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5974  PRC-barrel domain-containing protein  30.91 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4240  PRC-barrel domain-containing protein  32.41 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3579  PRC-barrel domain-containing protein  35.19 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.632038 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3986  PRC-barrel  30.91 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766762  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4381  PRC-barrel domain-containing protein  30.91 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206882  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2338  hypothetical protein  31.19 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.538206  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1014  PRC-barrel domain-containing protein  31.19 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0200  PRC-barrel  38.37 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0145  PRC-barrel domain protein  30 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0139  PRC-barrel domain protein  29.09 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.130291 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1587  PRC-barrel domain-containing protein  29.52 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3828  hypothetical protein  35.87 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1638  hypothetical protein  26.85 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900069  normal  0.195794 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5569  PRC-barrel domain-containing protein  29.63 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5289  PRC-barrel  29.63 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.928377  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3485  PRC-barrel domain protein  22.81 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.999892  normal  0.263816 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3285  PRC-barrel domain-containing protein  21.93 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1790  PRC-barrel domain-containing protein  31.4 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.981304  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3608  PRC-barrel domain protein  21.93 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.30312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4137  PRC-barrel domain-containing protein  21.01 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0140629 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2876  PRC-barrel domain-containing protein  22.76 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2103  PRC-barrel domain-containing protein  28.72 
 
 		 158 aa  53.5  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3502  PRC-barrel domain protein  28.38 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.002233 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4076  PRC-barrel  24.55 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5241  PRC-barrel domain protein  33.33 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5672  PRC-barrel domain protein  25.33 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0812  photosynthetic reaction center protein  26.97 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.212704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1989  PRC-barrel domain protein  25.49 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0920  PRC-barrel  30.16 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0390  PRC-barrel domain-containing protein  34.52 
 
 		 526 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1316  PRC-barrel domain protein  27.59 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976988  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1971  PRC-barrel domain-containing protein  24.56 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3524  PRC-barrel domain-containing protein  25.93 
 
 		 120 aa  48.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.990793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4517  PRC-barrel domain-containing protein  21.54 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4890  PRC-barrel  30.16 
 
 		 120 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3900  hypothetical protein  32.95 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0995  PRC-barrel domain-containing protein  26.09 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123984  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0931  PRC-barrel domain-containing protein  26.09 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4102  PRC-barrel  33.33 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997072  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3794  PRC-barrel  23.68 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.182164  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4254  PRC-barrel  37.1 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3931  PRC-barrel  32.08 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1343  PRC-barrel protein  33.33 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2361  PRC-barrel  30.19 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.000190048  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0549  hypothetical protein  34.48 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2428  hypothetical protein  29.03 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3980  PRC-barrel  37.1 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2175  PRC-barrel domain-containing protein  23.42 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1138  PRC-barrel domain protein  25.42 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000314637  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1396  PRC-barrel  26.67 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3323  PRC-barrel domain protein  22.83 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4152  PRC-barrel  22.47 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0389  PRC-barrel domain-containing protein  25.84 
 
 		 399 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3853  PRC-barrel  27.12 
 
 		 119 aa  42.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0805  PRC-barrel domain protein  21.67 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123295 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3019  PRC-barrel domain-containing protein  25.71 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3447  PRC-barrel domain protein  21.98 
 
 		 146 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3126  PRC-barrel domain-containing protein  22.47 
 
 		 173 aa  41.6  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.201028 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3337  PRC-barrel domain-containing protein  30.26 
 
 		 140 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1389  PRC-barrel domain protein  30.59 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1105  PRC-barrel domain-containing protein  26.67 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.25117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3192  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 212 aa  40.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2027  PRC-barrel domain-containing protein  32.1 
 
 		 172 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1248  PRC-barrel domain protein  26.23 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.416848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2972  PRC-barrel domain protein  33.8 
 
 		 214 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.42341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2167  PRC-barrel  31.03 
 
 		 187 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492056  normal  0.548798 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1128  PRC-barrel domain-containing protein  25.64 
 
 		 389 aa  40  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>