159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3485 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3485  PRC-barrel domain protein  100 
 
 		 135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.999892  normal  0.263816 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3285  PRC-barrel domain-containing protein  85.93 
 
 		 131 aa  226  8e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3608  PRC-barrel domain protein  85.19 
 
 		 131 aa  224  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.30312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4517  PRC-barrel domain-containing protein  76.07 
 
 		 142 aa  190  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1138  PRC-barrel domain protein  71.93 
 
 		 137 aa  155  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000314637  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2175  PRC-barrel domain-containing protein  64.52 
 
 		 137 aa  150  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0145  PRC-barrel domain protein  49.18 
 
 		 130 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0139  PRC-barrel domain protein  48.36 
 
 		 130 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.130291 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2876  PRC-barrel domain-containing protein  52.54 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2338  hypothetical protein  44.54 
 
 		 120 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.538206  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1014  PRC-barrel domain-containing protein  44.54 
 
 		 120 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1989  PRC-barrel domain protein  49.09 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4137  PRC-barrel domain-containing protein  46.96 
 
 		 129 aa  107  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0140629 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1587  PRC-barrel domain-containing protein  48.57 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3019  PRC-barrel domain-containing protein  56.52 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5241  PRC-barrel domain protein  53.76 
 
 		 117 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4890  PRC-barrel  55.06 
 
 		 120 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3502  PRC-barrel domain protein  45.95 
 
 		 129 aa  102  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.002233 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5672  PRC-barrel domain protein  42.52 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1160  hypothetical protein  37.69 
 
 		 175 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0805  PRC-barrel domain protein  41.41 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123295 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1359  PRC-barrel  38.89 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.73253  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6059  PRC-barrel domain-containing protein  38.89 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.185683 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6470  PRC-barrel domain-containing protein  38.89 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00723922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6353  PRC-barrel domain-containing protein  38.89 
 
 		 160 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0812  photosynthetic reaction center protein  52.81 
 
 		 117 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.212704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1316  PRC-barrel domain protein  46.34 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976988  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4218  PRC-barrel domain protein  40.54 
 
 		 157 aa  99.4  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1768  PRC-barrel domain-containing protein  40.54 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5446  PRC-barrel domain protein  36.92 
 
 		 175 aa  98.6  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5464  PRC-barrel domain-containing protein  38.89 
 
 		 161 aa  97.8  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3323  PRC-barrel domain protein  52.58 
 
 		 146 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3794  PRC-barrel  52.08 
 
 		 120 aa  97.4  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.182164  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2822  PRC-barrel domain-containing protein  52.94 
 
 		 122 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3126  PRC-barrel domain-containing protein  46.73 
 
 		 173 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.201028 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4945  hypothetical protein  38.74 
 
 		 154 aa  96.7  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0731378  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3447  PRC-barrel domain protein  51.55 
 
 		 146 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2570  hypothetical protein  38.74 
 
 		 158 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.53444e-20  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0920  PRC-barrel  54.22 
 
 		 117 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1971  PRC-barrel domain-containing protein  55.42 
 
 		 118 aa  96.7  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1690  PRC-barrel domain-containing protein  37.5 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6586  PRC-barrel domain protein  37.84 
 
 		 158 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000000440037  normal  0.0354416 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4152  PRC-barrel  45.13 
 
 		 133 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5679  PRC-barrel domain protein  40.32 
 
 		 190 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0391677  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5622  PRC-barrel domain-containing protein  37.3 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1361  PRC-barrel domain-containing protein  37.3 
 
 		 163 aa  94.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0070  PRC-barrel domain protein  38.74 
 
 		 156 aa  94.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5974  PRC-barrel domain-containing protein  38.81 
 
 		 163 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0931  PRC-barrel domain-containing protein  49.02 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3795  PRC-barrel domain-containing protein  39.82 
 
 		 165 aa  94.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3141  PRC-barrel domain-containing protein  37.3 
 
 		 163 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719915  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3012  PRC-barrel domain-containing protein  37.3 
 
 		 163 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0907577  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4260  PRC-barrel domain-containing protein  39.82 
 
 		 166 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.232503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5602  PRC-barrel domain-containing protein  39.52 
 
 		 190 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4240  PRC-barrel domain-containing protein  38.93 
 
 		 166 aa  94.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1396  PRC-barrel  44.14 
 
 		 122 aa  94  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3579  PRC-barrel domain-containing protein  40.91 
 
 		 155 aa  94  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.632038 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5072  PRC-barrel  37.84 
 
 		 163 aa  94  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.808195  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4102  PRC-barrel  48.28 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997072  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5293  PRC-barrel domain-containing protein  35.71 
 
 		 169 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.15156 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3464  PRC-barrel domain protein  48.86 
 
 		 122 aa  92  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4076  PRC-barrel  44.79 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2361  PRC-barrel  46.39 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.000190048  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3524  PRC-barrel domain-containing protein  48.51 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.990793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3986  PRC-barrel  38.64 
 
 		 163 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766762  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4381  PRC-barrel domain-containing protein  38.64 
 
 		 163 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206882  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0078  PRC-barrel domain protein  38.18 
 
 		 156 aa  90.9  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.559393 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0995  PRC-barrel domain-containing protein  39.02 
 
 		 132 aa  90.5  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123984  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1638  hypothetical protein  39.06 
 
 		 174 aa  89.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900069  normal  0.195794 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2428  hypothetical protein  50.59 
 
 		 137 aa  88.6  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1343  PRC-barrel protein  46.51 
 
 		 119 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3931  PRC-barrel  48.31 
 
 		 147 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0929  PRC-barrel domain-containing protein  32.76 
 
 		 122 aa  88.2  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13635  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3900  hypothetical protein  52.53 
 
 		 125 aa  88.2  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1923  PRC-barrel  35.09 
 
 		 183 aa  88.2  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0200  PRC-barrel  32.73 
 
 		 171 aa  84.3  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1152  PRC-barrel protein  42.53 
 
 		 111 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.8038  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3980  PRC-barrel  47.41 
 
 		 125 aa  84  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1539  hypothetical protein  37.39 
 
 		 485 aa  83.6  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4918  PRC-barrel  34.55 
 
 		 173 aa  83.6  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0486  hypothetical protein  34.23 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.299325  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4254  PRC-barrel  46.55 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1538  hypothetical protein  35.54 
 
 		 271 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2262  hypothetical protein  36.04 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.260475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1248  PRC-barrel domain protein  45.45 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.416848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1105  PRC-barrel domain-containing protein  45.45 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.25117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2302  hypothetical protein  30.84 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5289  PRC-barrel  32.43 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.928377  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5569  PRC-barrel domain-containing protein  32.43 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3652  hypothetical protein  45.88 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.440188  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1790  PRC-barrel domain-containing protein  31.78 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.981304  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1513  PRC-barrel  36.63 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.273224  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3853  PRC-barrel  38.1 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3814  PRC-barrel  41.9 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2171  PRC-barrel  44.83 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22411  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2506  PRC-barrel  44.83 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.754347  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0390  PRC-barrel domain-containing protein  34.94 
 
 		 526 aa  64.3  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0389  PRC-barrel domain-containing protein  35.29 
 
 		 399 aa  62.8  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  37.97 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3828  hypothetical protein  27.68 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>