167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5446 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5446  PRC-barrel domain protein  100 
 
 		 175 aa  358  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1160  hypothetical protein  92.57 
 
 		 175 aa  332  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5293  PRC-barrel domain-containing protein  73.94 
 
 		 169 aa  246  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.15156 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1361  PRC-barrel domain-containing protein  67.9 
 
 		 163 aa  217  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3141  PRC-barrel domain-containing protein  66.67 
 
 		 163 aa  217  7e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719915  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3012  PRC-barrel domain-containing protein  66.67 
 
 		 163 aa  217  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0907577  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5464  PRC-barrel domain-containing protein  77.27 
 
 		 161 aa  216  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5622  PRC-barrel domain-containing protein  76.52 
 
 		 160 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6353  PRC-barrel domain-containing protein  75.76 
 
 		 160 aa  214  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1359  PRC-barrel  73.48 
 
 		 160 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.73253  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6470  PRC-barrel domain-containing protein  73.48 
 
 		 160 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00723922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6059  PRC-barrel domain-containing protein  73.48 
 
 		 160 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.185683 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4240  PRC-barrel domain-containing protein  70 
 
 		 166 aa  201  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6586  PRC-barrel domain protein  68.57 
 
 		 158 aa  194  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000000440037  normal  0.0354416 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2570  hypothetical protein  70.77 
 
 		 158 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.53444e-20  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3795  PRC-barrel domain-containing protein  67.97 
 
 		 165 aa  190  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4260  PRC-barrel domain-containing protein  67.97 
 
 		 166 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.232503 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1690  PRC-barrel domain-containing protein  65.96 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0070  PRC-barrel domain protein  63.78 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3986  PRC-barrel  64.44 
 
 		 163 aa  185  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766762  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4381  PRC-barrel domain-containing protein  64.44 
 
 		 163 aa  185  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206882  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0078  PRC-barrel domain protein  63.49 
 
 		 156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.559393 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5974  PRC-barrel domain-containing protein  62.96 
 
 		 163 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5072  PRC-barrel  65.91 
 
 		 163 aa  181  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.808195  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1768  PRC-barrel domain-containing protein  72.97 
 
 		 148 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1638  hypothetical protein  63.28 
 
 		 174 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900069  normal  0.195794 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3579  PRC-barrel domain-containing protein  63.85 
 
 		 155 aa  174  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.632038 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4218  PRC-barrel domain protein  64.75 
 
 		 157 aa  174  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0486  hypothetical protein  61.42 
 
 		 158 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.299325  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4945  hypothetical protein  56.34 
 
 		 154 aa  170  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0731378  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4918  PRC-barrel  63.64 
 
 		 173 aa  157  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1923  PRC-barrel  54.48 
 
 		 183 aa  154  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1790  PRC-barrel domain-containing protein  53.39 
 
 		 139 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.981304  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2262  hypothetical protein  57.66 
 
 		 120 aa  145  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.260475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0200  PRC-barrel  55.17 
 
 		 171 aa  144  6e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2302  hypothetical protein  55.66 
 
 		 117 aa  137  7.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075687 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1539  hypothetical protein  48.33 
 
 		 485 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5289  PRC-barrel  53.04 
 
 		 142 aa  131  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.928377  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5569  PRC-barrel domain-containing protein  53.04 
 
 		 142 aa  131  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1513  PRC-barrel  53.51 
 
 		 140 aa  129  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.273224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1538  hypothetical protein  40.88 
 
 		 271 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0929  PRC-barrel domain-containing protein  46.9 
 
 		 122 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13635  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3285  PRC-barrel domain-containing protein  39.29 
 
 		 131 aa  99  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3485  PRC-barrel domain protein  36.92 
 
 		 135 aa  98.6  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.999892  normal  0.263816 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3608  PRC-barrel domain protein  39.29 
 
 		 131 aa  98.2  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.30312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4517  PRC-barrel domain-containing protein  38.39 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3828  hypothetical protein  41.44 
 
 		 117 aa  94  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3502  PRC-barrel domain protein  41.12 
 
 		 129 aa  88.6  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.002233 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2876  PRC-barrel domain-containing protein  39.66 
 
 		 122 aa  85.1  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0145  PRC-barrel domain protein  38.26 
 
 		 130 aa  84.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0139  PRC-barrel domain protein  37.39 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.130291 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0389  PRC-barrel domain-containing protein  37.11 
 
 		 399 aa  82.4  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1587  PRC-barrel domain-containing protein  38.32 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1971  PRC-barrel domain-containing protein  35.85 
 
 		 118 aa  82  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0805  PRC-barrel domain protein  33.96 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123295 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  36.43 
 
 		 234 aa  81.3  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2338  hypothetical protein  36.94 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.538206  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1014  PRC-barrel domain-containing protein  36.94 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4152  PRC-barrel  35.85 
 
 		 133 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1138  PRC-barrel domain protein  35.83 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000314637  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0390  PRC-barrel domain-containing protein  37.89 
 
 		 526 aa  79.7  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5672  PRC-barrel domain protein  32.48 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4137  PRC-barrel domain-containing protein  36.28 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0140629 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1989  PRC-barrel domain protein  35.85 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1316  PRC-barrel domain protein  38.66 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976988  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0995  PRC-barrel domain-containing protein  30.77 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123984  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2175  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2333  hypothetical protein  34.26 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.16959  normal  0.0255916 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2103  PRC-barrel domain-containing protein  36.36 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1396  PRC-barrel  32.46 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2822  PRC-barrel domain-containing protein  41.25 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0812  photosynthetic reaction center protein  36.79 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.212704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0931  PRC-barrel domain-containing protein  40.43 
 
 		 145 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4102  PRC-barrel  36.67 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997072  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5241  PRC-barrel domain protein  37.74 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4890  PRC-barrel  33.96 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0920  PRC-barrel  35.85 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3447  PRC-barrel domain protein  38.95 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3464  PRC-barrel domain protein  34.04 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3126  PRC-barrel domain-containing protein  38.95 
 
 		 173 aa  67.8  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.201028 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3323  PRC-barrel domain protein  37.89 
 
 		 146 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3019  PRC-barrel domain-containing protein  33.64 
 
 		 127 aa  67  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1248  PRC-barrel domain protein  30.7 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.416848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3794  PRC-barrel  35.56 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.182164  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3931  PRC-barrel  30.83 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1105  PRC-barrel domain-containing protein  30.63 
 
 		 121 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.25117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5602  PRC-barrel domain-containing protein  32.61 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5679  PRC-barrel domain protein  32.61 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0391677  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2428  hypothetical protein  35.23 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1343  PRC-barrel protein  40.54 
 
 		 119 aa  62  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3524  PRC-barrel domain-containing protein  35.79 
 
 		 120 aa  62  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.990793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2361  PRC-barrel  35.48 
 
 		 147 aa  62  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.000190048  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0934  PRC-barrel domain-containing protein  27.62 
 
 		 114 aa  60.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.889607 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2027  PRC-barrel domain-containing protein  39.13 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3192  PRC-barrel domain-containing protein  43.94 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4076  PRC-barrel  34.15 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0474  PRC-barrel domain-containing protein  32.08 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903154  hitchhiker  0.00309714 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1128  PRC-barrel domain-containing protein  30.71 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0433  PRC-barrel domain-containing protein  36.78 
 
 		 212 aa  57  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173009  normal  0.857282 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1152  PRC-barrel protein  35.37 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.8038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>