156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6059 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6059  PRC-barrel domain-containing protein  100 
 
 
160 aa  325  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.185683 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1359  PRC-barrel  100 
 
 
160 aa  325  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.73253  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6470  PRC-barrel domain-containing protein  100 
 
 
160 aa  325  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00723922  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6353  PRC-barrel domain-containing protein  95.62 
 
 
160 aa  313  7e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5622  PRC-barrel domain-containing protein  94.38 
 
 
160 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5464  PRC-barrel domain-containing protein  93.63 
 
 
161 aa  302  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1361  PRC-barrel domain-containing protein  74.85 
 
 
163 aa  247  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3141  PRC-barrel domain-containing protein  74.85 
 
 
163 aa  246  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719915  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3012  PRC-barrel domain-containing protein  74.85 
 
 
163 aa  246  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0907577  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1160  hypothetical protein  74.8 
 
 
175 aa  209  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5446  PRC-barrel domain protein  73.48 
 
 
175 aa  209  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4240  PRC-barrel domain-containing protein  69.63 
 
 
166 aa  203  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507205  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5293  PRC-barrel domain-containing protein  65.1 
 
 
169 aa  198  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.15156 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3795  PRC-barrel domain-containing protein  68.42 
 
 
165 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4260  PRC-barrel domain-containing protein  68.42 
 
 
166 aa  197  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.232503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1638  hypothetical protein  66.67 
 
 
174 aa  196  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900069  normal  0.195794 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3986  PRC-barrel  71.32 
 
 
163 aa  196  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766762  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4381  PRC-barrel domain-containing protein  71.32 
 
 
163 aa  196  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206882  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5974  PRC-barrel domain-containing protein  67.44 
 
 
163 aa  190  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0070  PRC-barrel domain protein  64.34 
 
 
156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2570  hypothetical protein  68.55 
 
 
158 aa  185  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.53444e-20  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1690  PRC-barrel domain-containing protein  60.27 
 
 
156 aa  185  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401907  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0078  PRC-barrel domain protein  64.06 
 
 
156 aa  185  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.559393 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6586  PRC-barrel domain protein  66.94 
 
 
158 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000000440037  normal  0.0354416 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0486  hypothetical protein  57.14 
 
 
158 aa  174  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.299325  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5072  PRC-barrel  63.28 
 
 
163 aa  173  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.808195  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4945  hypothetical protein  58.99 
 
 
154 aa  170  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0731378  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4218  PRC-barrel domain protein  60.98 
 
 
157 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3579  PRC-barrel domain-containing protein  68.18 
 
 
155 aa  165  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.632038 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1768  PRC-barrel domain-containing protein  64.86 
 
 
148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1923  PRC-barrel  58.87 
 
 
183 aa  157  8e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0200  PRC-barrel  59.13 
 
 
171 aa  148  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4918  PRC-barrel  57.27 
 
 
173 aa  147  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1790  PRC-barrel domain-containing protein  51.3 
 
 
139 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.981304  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2302  hypothetical protein  55.66 
 
 
117 aa  131  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075687 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2262  hypothetical protein  52.25 
 
 
120 aa  130  7.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.260475  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5289  PRC-barrel  46.48 
 
 
142 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.928377  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5569  PRC-barrel domain-containing protein  46.48 
 
 
142 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1539  hypothetical protein  47.86 
 
 
485 aa  126  9.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1513  PRC-barrel  53.15 
 
 
140 aa  122  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.273224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1538  hypothetical protein  38.81 
 
 
271 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0929  PRC-barrel domain-containing protein  45.54 
 
 
122 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13635  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3485  PRC-barrel domain protein  38.89 
 
 
135 aa  101  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.999892  normal  0.263816 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4517  PRC-barrel domain-containing protein  38.74 
 
 
142 aa  97.4  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3285  PRC-barrel domain-containing protein  39.13 
 
 
131 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3608  PRC-barrel domain protein  39.13 
 
 
131 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.30312  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2876  PRC-barrel domain-containing protein  38.79 
 
 
122 aa  90.9  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3502  PRC-barrel domain protein  37.38 
 
 
129 aa  90.1  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.002233 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3828  hypothetical protein  42.42 
 
 
117 aa  90.1  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0805  PRC-barrel domain protein  34.91 
 
 
125 aa  89  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.123295 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1138  PRC-barrel domain protein  36.89 
 
 
137 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000314637  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2175  PRC-barrel domain-containing protein  36.07 
 
 
137 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5672  PRC-barrel domain protein  31.4 
 
 
129 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1971  PRC-barrel domain-containing protein  34.55 
 
 
118 aa  82.8  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0145  PRC-barrel domain protein  35.65 
 
 
130 aa  81.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0139  PRC-barrel domain protein  36.28 
 
 
130 aa  81.3  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.130291 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4152  PRC-barrel  35.85 
 
 
133 aa  81.3  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1316  PRC-barrel domain protein  39.18 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976988  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1989  PRC-barrel domain protein  35.85 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4137  PRC-barrel domain-containing protein  34.78 
 
 
129 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0140629 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0389  PRC-barrel domain-containing protein  36.08 
 
 
399 aa  78.2  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2822  PRC-barrel domain-containing protein  35.78 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3464  PRC-barrel domain protein  31.62 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1396  PRC-barrel  32.08 
 
 
122 aa  77  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1587  PRC-barrel domain-containing protein  35.24 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4890  PRC-barrel  33.02 
 
 
120 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0812  photosynthetic reaction center protein  32.41 
 
 
117 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.212704  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0995  PRC-barrel domain-containing protein  29.91 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123984  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  38 
 
 
234 aa  74.7  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3447  PRC-barrel domain protein  37.23 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439764  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3126  PRC-barrel domain-containing protein  37.23 
 
 
173 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.201028 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3931  PRC-barrel  38.89 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0390  PRC-barrel domain-containing protein  37.89 
 
 
526 aa  74.3  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4102  PRC-barrel  39.08 
 
 
120 aa  73.9  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997072  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3323  PRC-barrel domain protein  39.29 
 
 
146 aa  73.9  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0931  PRC-barrel domain-containing protein  39.02 
 
 
145 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2338  hypothetical protein  34.45 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.538206  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5241  PRC-barrel domain protein  38.1 
 
 
117 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1014  PRC-barrel domain-containing protein  34.45 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0920  PRC-barrel  32.08 
 
 
117 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114023  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3524  PRC-barrel domain-containing protein  36.9 
 
 
120 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.990793  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2103  PRC-barrel domain-containing protein  35.48 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2361  PRC-barrel  38.04 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.000190048  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3794  PRC-barrel  39.76 
 
 
120 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.182164  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2333  hypothetical protein  33.64 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.16959  normal  0.0255916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3019  PRC-barrel domain-containing protein  33.04 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1248  PRC-barrel domain protein  29.31 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.416848  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1152  PRC-barrel protein  37.8 
 
 
111 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.8038  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1343  PRC-barrel protein  38.55 
 
 
119 aa  65.1  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5602  PRC-barrel domain-containing protein  27.27 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2428  hypothetical protein  35.63 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4076  PRC-barrel  32.93 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1105  PRC-barrel domain-containing protein  28.45 
 
 
121 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.25117  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5679  PRC-barrel domain protein  26.45 
 
 
190 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0391677  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1128  PRC-barrel domain-containing protein  40.62 
 
 
389 aa  59.3  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0474  PRC-barrel domain-containing protein  30.91 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903154  hitchhiker  0.00309714 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3900  hypothetical protein  31.78 
 
 
125 aa  58.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333239  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3980  PRC-barrel  31.03 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3652  hypothetical protein  36.36 
 
 
110 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.440188  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4254  PRC-barrel  31.03 
 
 
125 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>