143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4381 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3986  PRC-barrel  100 
 
 
163 aa  329  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766762  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4381  PRC-barrel domain-containing protein  100 
 
 
163 aa  329  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206882  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5974  PRC-barrel domain-containing protein  93.25 
 
 
163 aa  309  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1638  hypothetical protein  84.47 
 
 
174 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900069  normal  0.195794 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4260  PRC-barrel domain-containing protein  79.64 
 
 
166 aa  263  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.232503 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3795  PRC-barrel domain-containing protein  80.12 
 
 
165 aa  263  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4240  PRC-barrel domain-containing protein  74.85 
 
 
166 aa  248  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507205  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1361  PRC-barrel domain-containing protein  65.38 
 
 
163 aa  218  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3141  PRC-barrel domain-containing protein  65.38 
 
 
163 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719915  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3012  PRC-barrel domain-containing protein  65.38 
 
 
163 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0907577  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6353  PRC-barrel domain-containing protein  72.87 
 
 
160 aa  200  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1359  PRC-barrel  71.32 
 
 
160 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.73253  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6470  PRC-barrel domain-containing protein  71.32 
 
 
160 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00723922  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6059  PRC-barrel domain-containing protein  71.32 
 
 
160 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.185683 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5622  PRC-barrel domain-containing protein  71.32 
 
 
160 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5464  PRC-barrel domain-containing protein  71.32 
 
 
161 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5293  PRC-barrel domain-containing protein  61.15 
 
 
169 aa  185  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.15156 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5446  PRC-barrel domain protein  64.44 
 
 
175 aa  185  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1160  hypothetical protein  64.44 
 
 
175 aa  184  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0070  PRC-barrel domain protein  61.72 
 
 
156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0078  PRC-barrel domain protein  61.42 
 
 
156 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.559393 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2570  hypothetical protein  58.68 
 
 
158 aa  160  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.53444e-20  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6586  PRC-barrel domain protein  58.62 
 
 
158 aa  156  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000000440037  normal  0.0354416 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5072  PRC-barrel  61.21 
 
 
163 aa  154  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.808195  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1690  PRC-barrel domain-containing protein  50.34 
 
 
156 aa  154  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401907  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0486  hypothetical protein  51.49 
 
 
158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.299325  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4945  hypothetical protein  53.38 
 
 
154 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0731378  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4218  PRC-barrel domain protein  52.68 
 
 
157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3579  PRC-barrel domain-containing protein  52.03 
 
 
155 aa  145  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.632038 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0200  PRC-barrel  46.41 
 
 
171 aa  143  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1768  PRC-barrel domain-containing protein  51.79 
 
 
148 aa  142  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1923  PRC-barrel  54.78 
 
 
183 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1790  PRC-barrel domain-containing protein  45.67 
 
 
139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.981304  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4918  PRC-barrel  45.95 
 
 
173 aa  123  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2262  hypothetical protein  48.65 
 
 
120 aa  122  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.260475  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1539  hypothetical protein  46.49 
 
 
485 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1513  PRC-barrel  48.03 
 
 
140 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.273224  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2302  hypothetical protein  49.06 
 
 
117 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075687 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1538  hypothetical protein  41.67 
 
 
271 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5289  PRC-barrel  42.62 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.928377  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5569  PRC-barrel domain-containing protein  42.62 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0929  PRC-barrel domain-containing protein  49.47 
 
 
122 aa  106  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13635  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3485  PRC-barrel domain protein  38.64 
 
 
135 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.999892  normal  0.263816 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3285  PRC-barrel domain-containing protein  38.46 
 
 
131 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4517  PRC-barrel domain-containing protein  39.47 
 
 
142 aa  87  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3608  PRC-barrel domain protein  38.46 
 
 
131 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.30312  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3828  hypothetical protein  40 
 
 
117 aa  85.1  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3502  PRC-barrel domain protein  37.82 
 
 
129 aa  81.6  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.002233 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2876  PRC-barrel domain-containing protein  36.75 
 
 
122 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5672  PRC-barrel domain protein  33.33 
 
 
129 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1138  PRC-barrel domain protein  39.82 
 
 
137 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000314637  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2175  PRC-barrel domain-containing protein  34.56 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1316  PRC-barrel domain protein  36.45 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976988  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0389  PRC-barrel domain-containing protein  34.02 
 
 
399 aa  72.4  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0805  PRC-barrel domain protein  29.75 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.123295 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  32.17 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4152  PRC-barrel  33.02 
 
 
133 aa  70.5  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0139  PRC-barrel domain protein  32.56 
 
 
130 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.130291 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0931  PRC-barrel domain-containing protein  35.85 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1396  PRC-barrel  30.19 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0145  PRC-barrel domain protein  32.76 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1989  PRC-barrel domain protein  30.33 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0995  PRC-barrel domain-containing protein  30.77 
 
 
132 aa  67  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123984  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1587  PRC-barrel domain-containing protein  34.29 
 
 
119 aa  67  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3126  PRC-barrel domain-containing protein  34.26 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.201028 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3323  PRC-barrel domain protein  34.26 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2333  hypothetical protein  30.91 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.16959  normal  0.0255916 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1971  PRC-barrel domain-containing protein  31.13 
 
 
118 aa  66.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3447  PRC-barrel domain protein  34.26 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439764  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0390  PRC-barrel domain-containing protein  31.58 
 
 
526 aa  64.7  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2103  PRC-barrel domain-containing protein  34.41 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2338  hypothetical protein  31.25 
 
 
120 aa  63.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.538206  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1014  PRC-barrel domain-containing protein  31.25 
 
 
120 aa  63.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3019  PRC-barrel domain-containing protein  37.35 
 
 
127 aa  62.4  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4102  PRC-barrel  35.63 
 
 
120 aa  61.6  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997072  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4137  PRC-barrel domain-containing protein  30.43 
 
 
129 aa  60.8  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0140629 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3931  PRC-barrel  35.23 
 
 
147 aa  60.5  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5241  PRC-barrel domain protein  34.48 
 
 
117 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3464  PRC-barrel domain protein  26.5 
 
 
122 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4890  PRC-barrel  29.25 
 
 
120 aa  58.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3794  PRC-barrel  41.89 
 
 
120 aa  58.5  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.182164  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5602  PRC-barrel domain-containing protein  29.36 
 
 
190 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0920  PRC-barrel  31.4 
 
 
117 aa  58.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114023  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3524  PRC-barrel domain-containing protein  34.52 
 
 
120 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.990793  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2361  PRC-barrel  36.59 
 
 
147 aa  57.4  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.000190048  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0812  photosynthetic reaction center protein  29.76 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.212704  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5679  PRC-barrel domain protein  28.44 
 
 
190 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0391677  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2822  PRC-barrel domain-containing protein  29.36 
 
 
122 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0474  PRC-barrel domain-containing protein  31.43 
 
 
142 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903154  hitchhiker  0.00309714 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1128  PRC-barrel domain-containing protein  31.78 
 
 
389 aa  55.1  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4076  PRC-barrel  30.49 
 
 
121 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3652  hypothetical protein  40 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.440188  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2428  hypothetical protein  32.22 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1152  PRC-barrel protein  34.15 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.8038  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3321  PRC-barrel domain protein  32.22 
 
 
210 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74571  normal  0.282972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3124  PRC-barrel domain-containing protein  32.08 
 
 
229 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3445  PRC-barrel domain protein  32.22 
 
 
270 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424077  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1105  PRC-barrel domain-containing protein  28.44 
 
 
121 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.25117  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1343  PRC-barrel protein  36.49 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1277  PRC-barrel domain protein  34.21 
 
 
260 aa  50.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.244172  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>