124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1638 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1638  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  348  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900069  normal  0.195794 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3986  PRC-barrel  84.47 
 
 		 163 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766762  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4381  PRC-barrel domain-containing protein  84.47 
 
 		 163 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206882  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5974  PRC-barrel domain-containing protein  82.61 
 
 		 163 aa  269  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3795  PRC-barrel domain-containing protein  76.54 
 
 		 165 aa  249  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4260  PRC-barrel domain-containing protein  77.02 
 
 		 166 aa  248  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.232503 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4240  PRC-barrel domain-containing protein  73.91 
 
 		 166 aa  240  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1361  PRC-barrel domain-containing protein  60.13 
 
 		 163 aa  209  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3141  PRC-barrel domain-containing protein  60.13 
 
 		 163 aa  209  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719915  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3012  PRC-barrel domain-containing protein  60.13 
 
 		 163 aa  209  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0907577  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6353  PRC-barrel domain-containing protein  68.15 
 
 		 160 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1359  PRC-barrel  66.67 
 
 		 160 aa  196  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.73253  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6470  PRC-barrel domain-containing protein  66.67 
 
 		 160 aa  196  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00723922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6059  PRC-barrel domain-containing protein  66.67 
 
 		 160 aa  196  9e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.185683 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5622  PRC-barrel domain-containing protein  67.41 
 
 		 160 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5464  PRC-barrel domain-containing protein  67.41 
 
 		 161 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5293  PRC-barrel domain-containing protein  58.9 
 
 		 169 aa  189  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.15156 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1160  hypothetical protein  64.06 
 
 		 175 aa  180  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5446  PRC-barrel domain protein  63.28 
 
 		 175 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0070  PRC-barrel domain protein  58.59 
 
 		 156 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0078  PRC-barrel domain protein  58.27 
 
 		 156 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.559393 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2570  hypothetical protein  54.55 
 
 		 158 aa  157  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.53444e-20  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6586  PRC-barrel domain protein  55.17 
 
 		 158 aa  154  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000000440037  normal  0.0354416 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1690  PRC-barrel domain-containing protein  49.34 
 
 		 156 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5072  PRC-barrel  55.12 
 
 		 163 aa  148  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.808195  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0486  hypothetical protein  47.06 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.299325  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4218  PRC-barrel domain protein  49.11 
 
 		 157 aa  143  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3579  PRC-barrel domain-containing protein  49.59 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.632038 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4945  hypothetical protein  55.26 
 
 		 154 aa  142  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0731378  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1768  PRC-barrel domain-containing protein  49.11 
 
 		 148 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0200  PRC-barrel  44 
 
 		 171 aa  134  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1923  PRC-barrel  45.04 
 
 		 183 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1790  PRC-barrel domain-containing protein  45.69 
 
 		 139 aa  128  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.981304  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4918  PRC-barrel  41.44 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5289  PRC-barrel  45.08 
 
 		 142 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.928377  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5569  PRC-barrel domain-containing protein  45.08 
 
 		 142 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1513  PRC-barrel  43.51 
 
 		 140 aa  115  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.273224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1539  hypothetical protein  40.35 
 
 		 485 aa  114  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2262  hypothetical protein  42.34 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.260475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2302  hypothetical protein  43.81 
 
 		 117 aa  112  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075687 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1538  hypothetical protein  34.68 
 
 		 271 aa  105  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0929  PRC-barrel domain-containing protein  39.64 
 
 		 122 aa  99.8  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13635  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3485  PRC-barrel domain protein  39.06 
 
 		 135 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.999892  normal  0.263816 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3285  PRC-barrel domain-containing protein  37.61 
 
 		 131 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3608  PRC-barrel domain protein  37.61 
 
 		 131 aa  84.3  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.30312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4517  PRC-barrel domain-containing protein  36.84 
 
 		 142 aa  84.3  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3502  PRC-barrel domain protein  42.22 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.002233 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3828  hypothetical protein  37 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2876  PRC-barrel domain-containing protein  34.19 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2175  PRC-barrel domain-containing protein  33.09 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1138  PRC-barrel domain protein  33.57 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000314637  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0805  PRC-barrel domain protein  30.58 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123295 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  33 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1396  PRC-barrel  27.69 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0389  PRC-barrel domain-containing protein  30 
 
 		 399 aa  66.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5672  PRC-barrel domain protein  28.07 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0995  PRC-barrel domain-containing protein  30.77 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123984  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4152  PRC-barrel  30.19 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0139  PRC-barrel domain protein  29.46 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.130291 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1587  PRC-barrel domain-containing protein  32.08 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1316  PRC-barrel domain protein  31.43 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976988  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1989  PRC-barrel domain protein  28.57 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1971  PRC-barrel domain-containing protein  30.48 
 
 		 118 aa  62  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0390  PRC-barrel domain-containing protein  30.53 
 
 		 526 aa  61.2  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0145  PRC-barrel domain protein  29.82 
 
 		 130 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2333  hypothetical protein  26.85 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.16959  normal  0.0255916 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4102  PRC-barrel  34.48 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997072  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5602  PRC-barrel domain-containing protein  29.36 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3323  PRC-barrel domain protein  32.76 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3447  PRC-barrel domain protein  31.9 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2338  hypothetical protein  29.2 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.538206  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1014  PRC-barrel domain-containing protein  29.2 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3126  PRC-barrel domain-containing protein  31.9 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.201028 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0931  PRC-barrel domain-containing protein  30.56 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5679  PRC-barrel domain protein  28.44 
 
 		 190 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0391677  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0920  PRC-barrel  31.03 
 
 		 117 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.114023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0812  photosynthetic reaction center protein  28.74 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.212704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4890  PRC-barrel  31.03 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3931  PRC-barrel  32.95 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2103  PRC-barrel domain-containing protein  29.79 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5241  PRC-barrel domain protein  32.14 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3464  PRC-barrel domain protein  25 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3794  PRC-barrel  39.19 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.182164  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4137  PRC-barrel domain-containing protein  32.18 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0140629 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1248  PRC-barrel domain protein  29.66 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.416848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3019  PRC-barrel domain-containing protein  32.18 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2361  PRC-barrel  32.93 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.000190048  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1105  PRC-barrel domain-containing protein  27.68 
 
 		 121 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.25117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2822  PRC-barrel domain-containing protein  29.13 
 
 		 122 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4076  PRC-barrel  29.47 
 
 		 121 aa  52.4  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1152  PRC-barrel protein  31.13 
 
 		 111 aa  52.4  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.8038  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1128  PRC-barrel domain-containing protein  43.64 
 
 		 389 aa  52.4  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3524  PRC-barrel domain-containing protein  30.95 
 
 		 120 aa  52  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.990793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1277  PRC-barrel domain protein  35.87 
 
 		 260 aa  51.2  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.244172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1343  PRC-barrel protein  35.14 
 
 		 119 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2428  hypothetical protein  30 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3445  PRC-barrel domain protein  34.57 
 
 		 270 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3124  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 229 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3321  PRC-barrel domain protein  34.57 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74571  normal  0.282972 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3853  PRC-barrel  30.39 
 
 		 119 aa  48.5  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>