94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1002 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1002  PRC-barrel domain-containing protein  100 
 
 		 164 aa  311  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.898578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3831  PRC-barrel domain protein  30.59 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1049  PRC-barrel domain protein  33.55 
 
 		 146 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.340266 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4630  PRC-barrel domain-containing protein  38.64 
 
 		 167 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0944476 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7367  PRC-barrel domain protein  37.65 
 
 		 293 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00459502  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3101  PRC-barrel  32.33 
 
 		 400 aa  58.5  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2461  hypothetical protein  48.15 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.389117 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3424  PRC-barrel domain-containing protein  35.87 
 
 		 250 aa  57.8  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39453  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3743  PRC-barrel domain protein  30.63 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2784  hypothetical protein  38.37 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.146377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6618  PRC-barrel domain-containing protein  37.65 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235295  normal  0.328597 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0263  PRC-barrel domain-containing protein  35.29 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1648  PRC-barrel domain-containing protein  45 
 
 		 220 aa  57  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2888  PRC-barrel  49.06 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22527  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2027  PRC-barrel domain-containing protein  40.59 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2167  PRC-barrel  43.4 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492056  normal  0.548798 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3526  PRC-barrel domain-containing protein  44.26 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2897  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.020112 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3212  PRC-barrel  37.89 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.658486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6545  PRC-barrel domain-containing protein  29.21 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.679838  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5649  PRC-barrel domain-containing protein  31.76 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1539  hypothetical protein  43.68 
 
 		 485 aa  54.7  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3192  PRC-barrel domain-containing protein  45 
 
 		 212 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0433  PRC-barrel domain-containing protein  30.16 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173009  normal  0.857282 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1963  photosynthetic reaction center protein  45.28 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0050  PRC-barrel domain-containing protein  39.51 
 
 		 263 aa  51.2  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.808352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5914  PRC-barrel  39.62 
 
 		 140 aa  51.2  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73719  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0419  PRC-barrel  40.24 
 
 		 169 aa  50.8  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2130  PRC-barrel domain-containing protein  38.3 
 
 		 196 aa  50.8  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3445  PRC-barrel domain protein  34.38 
 
 		 270 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2854  PRC-barrel domain-containing protein  54 
 
 		 214 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.813068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3124  PRC-barrel domain-containing protein  34.38 
 
 		 229 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3080  PRC-barrel domain protein  54 
 
 		 214 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3321  PRC-barrel domain protein  35.29 
 
 		 210 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74571  normal  0.282972 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2972  PRC-barrel domain protein  54 
 
 		 214 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.42341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1610  hypothetical protein  32.38 
 
 		 280 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1144  PRC-barrel  37.5 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.016878 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1538  hypothetical protein  32.8 
 
 		 271 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4087  PRC-barrel domain protein  35.14 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1662  hypothetical protein  32.38 
 
 		 280 aa  50.1  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1003  PRC-barrel domain-containing protein  26.53 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2103  PRC-barrel domain-containing protein  35.8 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  30.3 
 
 		 234 aa  49.7  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1252  PRC-barrel domain-containing protein  35.11 
 
 		 284 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.864709  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3337  PRC-barrel domain-containing protein  40 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4129  PRC-barrel  32.79 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.674584  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2262  hypothetical protein  39.29 
 
 		 120 aa  48.9  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.260475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1923  PRC-barrel  35.8 
 
 		 183 aa  48.9  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1301  PRC-barrel domain protein  41.38 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3426  PRC-barrel  38.89 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2302  hypothetical protein  35.8 
 
 		 117 aa  48.5  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075687 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1267  PRC-barrel domain protein  54 
 
 		 211 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1389  PRC-barrel domain protein  31.52 
 
 		 148 aa  48.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3869  hypothetical protein  25.78 
 
 		 157 aa  47.4  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.591941 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0078  PRC-barrel domain protein  41.77 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.559393 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4656  PRC-barrel domain protein  33.71 
 
 		 141 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.965669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5446  PRC-barrel domain protein  36.08 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0070  PRC-barrel domain protein  41.77 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3564  PRC-barrel domain-containing protein  37.93 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.589569 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5072  PRC-barrel  41.77 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.808195  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4885  PRC-barrel domain-containing protein  32.58 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330906  normal  0.110726 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0930  hypothetical protein  32.58 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.326505  normal  0.347558 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2065  PRC protein  32.31 
 
 		 285 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5435  PRC-barrel domain-containing protein  32.58 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0499  PRC-barrel domain protein  41.67 
 
 		 201 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.484465 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0549  hypothetical protein  34.48 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0542  PRC-barrel domain protein  41.67 
 
 		 201 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0200  PRC-barrel  33.33 
 
 		 171 aa  45.1  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2697  PRC-barrel  36.36 
 
 		 300 aa  44.7  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.289885  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0389  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 399 aa  44.7  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5290  PRC-barrel domain protein  37.04 
 
 		 134 aa  44.3  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1160  hypothetical protein  37.97 
 
 		 175 aa  44.3  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0929  PRC-barrel domain-containing protein  37.18 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13635  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1321  hypothetical protein  39.29 
 
 		 134 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0470911  normal  0.0599346 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4622  PRC-barrel domain-containing protein  35.59 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670971 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4398  PRC-barrel domain-containing protein  34.04 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1513  PRC-barrel  33.73 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.273224  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5293  PRC-barrel domain-containing protein  39.24 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.15156 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5606  PRC-barrel domain-containing protein  35.59 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.958862  normal  0.410913 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5253  PRC-barrel  35.59 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0915  hypothetical protein  57.5 
 
 		 177 aa  42.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1989  PRC-barrel domain protein  42.22 
 
 		 112 aa  41.6  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4517  PRC-barrel domain-containing protein  29.59 
 
 		 142 aa  41.6  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1971  PRC-barrel domain-containing protein  38.6 
 
 		 118 aa  41.2  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4945  hypothetical protein  37.97 
 
 		 154 aa  41.2  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0731378  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1911  hypothetical protein  35.63 
 
 		 109 aa  41.2  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1368  hypothetical protein  30 
 
 		 436 aa  40.8  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6586  PRC-barrel domain protein  35.44 
 
 		 158 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000000440037  normal  0.0354416 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0338  putative lipoprotein  30 
 
 		 326 aa  40.4  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.560334  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1217  putative lipoprotein  30 
 
 		 326 aa  40.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1055  hypothetical protein  30 
 
 		 326 aa  40.4  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0813  putative lipoprotein  30 
 
 		 326 aa  40.4  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.925981  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1209  putative lipoprotein  30 
 
 		 326 aa  40.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2570  hypothetical protein  34.94 
 
 		 158 aa  40.4  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.53444e-20  normal  0.143128 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>