103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1128 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1128  PRC-barrel domain-containing protein  100 
 
 		 389 aa  782    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1539  hypothetical protein  25.9 
 
 		 485 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1538  hypothetical protein  26.44 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0200  PRC-barrel  27.69 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0929  PRC-barrel domain-containing protein  36.08 
 
 		 122 aa  62.8  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13635  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0486  hypothetical protein  34.68 
 
 		 158 aa  61.6  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.299325  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1923  PRC-barrel  36.78 
 
 		 183 aa  61.6  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2027  PRC-barrel domain-containing protein  45.78 
 
 		 172 aa  61.2  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1361  PRC-barrel domain-containing protein  30 
 
 		 163 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1359  PRC-barrel  40.62 
 
 		 160 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.73253  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5622  PRC-barrel domain-containing protein  42.19 
 
 		 160 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6470  PRC-barrel domain-containing protein  40.62 
 
 		 160 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00723922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3141  PRC-barrel domain-containing protein  30 
 
 		 163 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719915  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3012  PRC-barrel domain-containing protein  30 
 
 		 163 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0907577  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6059  PRC-barrel domain-containing protein  40.62 
 
 		 160 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.185683 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6353  PRC-barrel domain-containing protein  42.19 
 
 		 160 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2262  hypothetical protein  45.76 
 
 		 120 aa  58.9  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.260475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1513  PRC-barrel  47.17 
 
 		 140 aa  58.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.273224  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5464  PRC-barrel domain-containing protein  42.19 
 
 		 161 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2302  hypothetical protein  31.13 
 
 		 117 aa  57.8  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075687 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5446  PRC-barrel domain protein  30.71 
 
 		 175 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3485  PRC-barrel domain protein  39.47 
 
 		 135 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.999892  normal  0.263816 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0995  PRC-barrel domain-containing protein  37.35 
 
 		 132 aa  57.4  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123984  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6586  PRC-barrel domain protein  37.29 
 
 		 158 aa  57  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000000440037  normal  0.0354416 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2570  hypothetical protein  37.29 
 
 		 158 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.53444e-20  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4945  hypothetical protein  28.04 
 
 		 154 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0731378  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0390  PRC-barrel domain-containing protein  48 
 
 		 526 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5974  PRC-barrel domain-containing protein  31.78 
 
 		 163 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1160  hypothetical protein  39.66 
 
 		 175 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3986  PRC-barrel  31.78 
 
 		 163 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766762  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4381  PRC-barrel domain-containing protein  31.78 
 
 		 163 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206882  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1768  PRC-barrel domain-containing protein  37.93 
 
 		 148 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5293  PRC-barrel domain-containing protein  37.93 
 
 		 169 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.15156 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3502  PRC-barrel domain protein  41.82 
 
 		 129 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.002233 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4240  PRC-barrel domain-containing protein  43.64 
 
 		 166 aa  54.7  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1321  hypothetical protein  39.13 
 
 		 134 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0470911  normal  0.0599346 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4218  PRC-barrel domain protein  37.93 
 
 		 157 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0070  PRC-barrel domain protein  40.68 
 
 		 156 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0078  PRC-barrel domain protein  40.68 
 
 		 156 aa  53.9  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.559393 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5672  PRC-barrel domain protein  30.28 
 
 		 129 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2888  PRC-barrel  44.83 
 
 		 174 aa  53.5  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22527  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3579  PRC-barrel domain-containing protein  36.21 
 
 		 155 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.632038 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5290  PRC-barrel domain protein  38.64 
 
 		 134 aa  53.1  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1638  hypothetical protein  43.64 
 
 		 174 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900069  normal  0.195794 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0433  PRC-barrel domain-containing protein  36.36 
 
 		 212 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173009  normal  0.857282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1316  PRC-barrel domain protein  40.54 
 
 		 145 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976988  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5072  PRC-barrel  36.92 
 
 		 163 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.808195  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2461  hypothetical protein  41.38 
 
 		 169 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.389117 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3285  PRC-barrel domain-containing protein  35.59 
 
 		 131 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3608  PRC-barrel domain protein  35.59 
 
 		 131 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.30312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1267  PRC-barrel domain protein  32.08 
 
 		 211 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3795  PRC-barrel domain-containing protein  41.07 
 
 		 165 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0389  PRC-barrel domain-containing protein  32.86 
 
 		 399 aa  51.2  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4260  PRC-barrel domain-containing protein  41.07 
 
 		 166 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.232503 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3019  PRC-barrel domain-containing protein  35 
 
 		 127 aa  51.6  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2167  PRC-barrel  41.38 
 
 		 187 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492056  normal  0.548798 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1971  PRC-barrel domain-containing protein  34.78 
 
 		 118 aa  50.1  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1690  PRC-barrel domain-containing protein  41.46 
 
 		 156 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0931  PRC-barrel domain-containing protein  36.23 
 
 		 145 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3828  hypothetical protein  37.93 
 
 		 117 aa  49.7  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5649  PRC-barrel domain-containing protein  38.3 
 
 		 134 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1301  PRC-barrel domain protein  36.71 
 
 		 163 aa  49.3  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3869  hypothetical protein  33.78 
 
 		 157 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.591941 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3212  PRC-barrel  37.33 
 
 		 193 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.658486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4087  PRC-barrel domain protein  35.23 
 
 		 179 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  34.02 
 
 		 234 aa  47.8  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1963  photosynthetic reaction center protein  44.64 
 
 		 187 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4517  PRC-barrel domain-containing protein  33.9 
 
 		 142 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0542  PRC-barrel domain protein  45.45 
 
 		 201 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3126  PRC-barrel domain-containing protein  36.49 
 
 		 173 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.201028 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0499  PRC-barrel domain protein  45.45 
 
 		 201 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.484465 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1989  PRC-barrel domain protein  33.78 
 
 		 112 aa  47.4  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3447  PRC-barrel domain protein  36.49 
 
 		 146 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3323  PRC-barrel domain protein  36.49 
 
 		 146 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5914  PRC-barrel  40 
 
 		 140 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73719  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4918  PRC-barrel  34.88 
 
 		 173 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1396  PRC-barrel  36.92 
 
 		 122 aa  45.8  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5289  PRC-barrel  38.16 
 
 		 142 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.928377  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5569  PRC-barrel domain-containing protein  38.16 
 
 		 142 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1790  PRC-barrel domain-containing protein  38.89 
 
 		 139 aa  46.2  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.981304  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4890  PRC-barrel  30 
 
 		 120 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3426  PRC-barrel  41.27 
 
 		 178 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1003  PRC-barrel domain-containing protein  39.66 
 
 		 147 aa  45.4  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4137  PRC-barrel domain-containing protein  35.29 
 
 		 129 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0140629 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4630  PRC-barrel domain-containing protein  33.96 
 
 		 167 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0944476 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2822  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 122 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2065  PRC protein  33.33 
 
 		 285 aa  44.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0930  hypothetical protein  46.03 
 
 		 141 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.326505  normal  0.347558 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1285  hypothetical protein  19.91 
 
 		 253 aa  44.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2784  hypothetical protein  34.78 
 
 		 144 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.146377 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2876  PRC-barrel domain-containing protein  30.91 
 
 		 122 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3564  PRC-barrel domain-containing protein  29.91 
 
 		 137 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.589569 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5241  PRC-barrel domain protein  37.1 
 
 		 117 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0805  PRC-barrel domain protein  34.18 
 
 		 125 aa  44.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123295 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1144  PRC-barrel  38.1 
 
 		 157 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.016878 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0419  PRC-barrel  32.5 
 
 		 169 aa  43.9  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2897  hypothetical protein  32.69 
 
 		 140 aa  43.9  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.020112 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2103  PRC-barrel domain-containing protein  34.67 
 
 		 158 aa  43.9  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4656  PRC-barrel domain protein  46.03 
 
 		 141 aa  43.5  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.965669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2338  hypothetical protein  33.85 
 
 		 120 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.538206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>