50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5489 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5489  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  291  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.240077 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6894  hypothetical protein  90.09 
 
 
111 aa  207  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505741  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3691  hypothetical protein  59.59 
 
 
146 aa  187  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133454  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2373  hypothetical protein  58.27 
 
 
145 aa  173  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.662608  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5435  PRC-barrel domain-containing protein  57.78 
 
 
142 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4885  PRC-barrel domain-containing protein  57.78 
 
 
142 aa  163  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330906  normal  0.110726 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0930  hypothetical protein  56.67 
 
 
141 aa  150  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.326505  normal  0.347558 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3233  PRC-barrel domain-containing protein  57.75 
 
 
142 aa  147  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.437762 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4656  PRC-barrel domain protein  55 
 
 
141 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.965669  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0088  hypothetical protein  56.67 
 
 
142 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4622  PRC-barrel domain-containing protein  56.67 
 
 
142 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670971 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5606  PRC-barrel domain-containing protein  56.67 
 
 
142 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.958862  normal  0.410913 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5253  PRC-barrel  56.67 
 
 
142 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4133  PRC-barrel domain protein  42.75 
 
 
143 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0559  hypothetical protein  42.75 
 
 
143 aa  136  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4398  PRC-barrel domain-containing protein  57.55 
 
 
135 aa  130  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1802  PRC-barrel domain protein  48.84 
 
 
136 aa  115  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2126  PRC-barrel domain protein  52.8 
 
 
136 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0283705  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3337  PRC-barrel domain-containing protein  49.06 
 
 
140 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5914  PRC-barrel  43.4 
 
 
140 aa  90.9  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73719  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0549  hypothetical protein  33.66 
 
 
130 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5290  PRC-barrel domain protein  35.71 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1321  hypothetical protein  33.59 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0470911  normal  0.0599346 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3564  PRC-barrel domain-containing protein  31.48 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.589569 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4129  PRC-barrel  29.2 
 
 
140 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.674584  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5718  PRC-barrel domain-containing protein  32.94 
 
 
231 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099038  hitchhiker  0.00405289 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2897  hypothetical protein  28.68 
 
 
140 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.020112 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1301  PRC-barrel domain protein  34.33 
 
 
163 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2027  PRC-barrel domain-containing protein  39.24 
 
 
172 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0542  PRC-barrel domain protein  27.71 
 
 
201 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0499  PRC-barrel domain protein  27.71 
 
 
201 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.484465 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0433  PRC-barrel domain-containing protein  28.75 
 
 
212 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173009  normal  0.857282 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3424  PRC-barrel domain-containing protein  24.56 
 
 
250 aa  45.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39453  normal  0.477844 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2130  PRC-barrel domain-containing protein  29.29 
 
 
196 aa  44.3  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4087  PRC-barrel domain protein  27.03 
 
 
179 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0070  PRC-barrel domain protein  29.76 
 
 
156 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0078  PRC-barrel domain protein  29.76 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.559393 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3828  hypothetical protein  30.68 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3831  PRC-barrel domain protein  28.21 
 
 
169 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3101  PRC-barrel  29.07 
 
 
400 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1267  PRC-barrel domain protein  36.54 
 
 
211 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4918  PRC-barrel  29.59 
 
 
173 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5072  PRC-barrel  31.65 
 
 
163 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.808195  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1963  photosynthetic reaction center protein  28 
 
 
187 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.458203  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1610  hypothetical protein  29.41 
 
 
280 aa  40.8  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1662  hypothetical protein  29.41 
 
 
280 aa  40.8  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2167  PRC-barrel  31.34 
 
 
187 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492056  normal  0.548798 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2972  PRC-barrel domain protein  34.48 
 
 
214 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.42341  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1648  PRC-barrel domain-containing protein  39.13 
 
 
220 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2461  hypothetical protein  32 
 
 
169 aa  40  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.389117 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>