30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2042 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2042  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  291  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437546  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1132  hypothetical protein  49.26 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933223  hitchhiker  0.000112496 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1242  hypothetical protein  55.34 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3797  hypothetical protein  45.77 
 
 		 136 aa  111  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.568701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4091  hypothetical protein  52.53 
 
 		 130 aa  96.7  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7896  hypothetical protein  53.85 
 
 		 123 aa  92.8  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2564  hypothetical protein  43.01 
 
 		 119 aa  67  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4687  hypothetical protein  43.59 
 
 		 312 aa  55.1  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00986702  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3366  hypothetical protein  37.61 
 
 		 292 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1639  hypothetical protein  31.94 
 
 		 261 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000185406  hitchhiker  0.0000000387039 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2721  hypothetical protein  31.94 
 
 		 261 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2738  hypothetical protein  31.94 
 
 		 261 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000701952  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1697  hypothetical protein  39.73 
 
 		 261 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1131  hypothetical protein  32.35 
 
 		 243 aa  51.6  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891613  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2309  hypothetical protein  29.79 
 
 		 277 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.363913  normal  0.020455 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1657  hypothetical protein  39.39 
 
 		 311 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.157539 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  40 
 
 		 304 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0556  hypothetical protein  35.44 
 
 		 269 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.473562 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1878  hypothetical protein  44.68 
 
 		 324 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1683  hypothetical protein  32.5 
 
 		 272 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2296  hypothetical protein  28.87 
 
 		 277 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2344  PRC-barrel domain protein  36.25 
 
 		 258 aa  46.2  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3899  hypothetical protein  32.5 
 
 		 272 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3822  hypothetical protein  38.89 
 
 		 268 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1986  hypothetical protein  35.37 
 
 		 248 aa  45.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1966  hypothetical protein  27.27 
 
 		 279 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5285  hypothetical protein  29.73 
 
 		 259 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5572  hypothetical protein  29.73 
 
 		 259 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1285  hypothetical protein  31.08 
 
 		 253 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0924  PRC-barrel domain protein  37.93 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>