52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2344 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2344  PRC-barrel domain protein  100 
 
 		 258 aa  525  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1986  hypothetical protein  44.27 
 
 		 248 aa  202  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1966  hypothetical protein  39.33 
 
 		 279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1131  hypothetical protein  39.52 
 
 		 243 aa  195  6e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891613  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2309  hypothetical protein  40.08 
 
 		 277 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.363913  normal  0.020455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2296  hypothetical protein  40.08 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2738  hypothetical protein  37.88 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000701952  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1639  hypothetical protein  37.5 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000185406  hitchhiker  0.0000000387039 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2721  hypothetical protein  37.5 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1697  hypothetical protein  41.09 
 
 		 261 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3822  hypothetical protein  40.3 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0556  hypothetical protein  41.15 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.473562 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5572  hypothetical protein  39.69 
 
 		 259 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5285  hypothetical protein  39.3 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3899  hypothetical protein  35.88 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1683  hypothetical protein  36.19 
 
 		 272 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01282  hypothetical protein  31.84 
 
 		 249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000306501  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1285  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  142  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1999  hypothetical protein  32.95 
 
 		 100 aa  74.7  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.145821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1132  hypothetical protein  31.78 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933223  hitchhiker  0.000112496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7896  hypothetical protein  35.35 
 
 		 123 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1242  hypothetical protein  31.25 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4658  PRC-barrel protein  43.28 
 
 		 292 aa  53.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  31.97 
 
 		 304 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3366  hypothetical protein  37.35 
 
 		 292 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4091  hypothetical protein  34.69 
 
 		 130 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1538  hypothetical protein  20 
 
 		 271 aa  49.7  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5446  PRC-barrel domain protein  25.56 
 
 		 175 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1878  hypothetical protein  31.54 
 
 		 324 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1160  hypothetical protein  26.32 
 
 		 175 aa  49.7  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1657  hypothetical protein  32.58 
 
 		 311 aa  48.9  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.157539 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2564  hypothetical protein  31.91 
 
 		 119 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0823  PRC-barrel domain protein  34.65 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2570  hypothetical protein  27.43 
 
 		 158 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.53444e-20  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4687  hypothetical protein  31.36 
 
 		 312 aa  46.2  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00986702  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0474  PRC-barrel domain-containing protein  29.81 
 
 		 142 aa  46.2  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903154  hitchhiker  0.00309714 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2042  hypothetical protein  36.25 
 
 		 142 aa  46.2  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437546  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0277  hypothetical protein  38.57 
 
 		 282 aa  45.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0810236  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3327  hypothetical protein  25 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5289  PRC-barrel  31.62 
 
 		 142 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.928377  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3795  PRC-barrel domain-containing protein  25.98 
 
 		 165 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5569  PRC-barrel domain-containing protein  31.62 
 
 		 142 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1768  PRC-barrel domain-containing protein  26.13 
 
 		 148 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2338  hypothetical protein  27.12 
 
 		 120 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.538206  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4260  PRC-barrel domain-containing protein  25.98 
 
 		 166 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.232503 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1539  hypothetical protein  20.31 
 
 		 485 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0251  hypothetical protein  37.14 
 
 		 284 aa  43.5  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.507454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1014  PRC-barrel domain-containing protein  27.12 
 
 		 120 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2012  PRC-barrel domain-containing protein  38.57 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.621139  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4240  PRC-barrel domain-containing protein  24.44 
 
 		 166 aa  42.7  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1454  hypothetical protein  51.43 
 
 		 288 aa  42.4  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649644  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6353  PRC-barrel domain-containing protein  24.81 
 
 		 160 aa  42  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>