22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4491 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4491  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  532  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3366  hypothetical protein  50.87 
 
 
292 aa  261  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1657  hypothetical protein  41.48 
 
 
311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.157539 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4688  hypothetical protein  42.55 
 
 
280 aa  218  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0233985  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1656  hypothetical protein  41.58 
 
 
281 aa  211  7e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1878  hypothetical protein  38.85 
 
 
324 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340374  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4687  hypothetical protein  38.54 
 
 
312 aa  208  7e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00986702  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  37.5 
 
 
304 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1454  hypothetical protein  35.71 
 
 
288 aa  113  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649644  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4129  PRC-barrel domain protein  39.17 
 
 
233 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0790965  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2012  PRC-barrel domain-containing protein  32.23 
 
 
282 aa  96.3  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.621139  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0924  PRC-barrel domain protein  36.75 
 
 
119 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0277  hypothetical protein  30.96 
 
 
282 aa  88.6  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0810236  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0251  hypothetical protein  31.38 
 
 
284 aa  85.1  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.507454  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4658  PRC-barrel protein  28.89 
 
 
292 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4280  hypothetical protein  37.04 
 
 
111 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3305  hypothetical protein  32.23 
 
 
234 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3384  hypothetical protein  31.71 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3189  hypothetical protein  31.4 
 
 
233 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03600  conserved domain protein, TIGR02271+C111  29.63 
 
 
380 aa  43.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.67855 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1989  PRC-barrel domain protein  29.9 
 
 
112 aa  42.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1212  PRC-barrel domain-containing protein  31.18 
 
 
213 aa  42.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  0.163057 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>