27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3384 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3384  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  455  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3305  hypothetical protein  93.59 
 
 
234 aa  428  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3189  hypothetical protein  85.04 
 
 
233 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1547  hypothetical protein  64.93 
 
 
246 aa  263  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03600  conserved domain protein, TIGR02271+C111  39.26 
 
 
380 aa  75.5  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.67855 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3366  hypothetical protein  41.27 
 
 
292 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  36.89 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1878  hypothetical protein  39.01 
 
 
324 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340374  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4955  Domain of unknown function DUF2382-like protein  41.27 
 
 
366 aa  65.5  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.987311  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4690  Domain of unknown function DUF2382-like protein  41.27 
 
 
301 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1657  hypothetical protein  41.38 
 
 
311 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.157539 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07780  hypothetical protein  41.07 
 
 
283 aa  60.8  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.374906 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23200  hypothetical protein  37.88 
 
 
273 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.738381  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2910  PRC-barrel domain protein  45.36 
 
 
287 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1454  hypothetical protein  28.57 
 
 
288 aa  53.1  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649644  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1656  hypothetical protein  33.33 
 
 
281 aa  49.7  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0172  hypothetical protein  29.06 
 
 
561 aa  49.3  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0383324  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2858  hypothetical protein  33.61 
 
 
162 aa  49.3  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.262338  normal  0.333542 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4688  hypothetical protein  30.71 
 
 
280 aa  47.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0233985  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4491  hypothetical protein  31.71 
 
 
266 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3466  PRC-barrel domain protein  41.96 
 
 
299 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  hitchhiker  0.00773613 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1869  hypothetical protein  35.16 
 
 
301 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3951  hypothetical protein  40.62 
 
 
174 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.165863 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0823  PRC-barrel domain protein  36.28 
 
 
307 aa  45.4  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4687  hypothetical protein  33.83 
 
 
312 aa  44.7  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00986702  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2012  PRC-barrel domain-containing protein  32.56 
 
 
282 aa  42.7  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.621139  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3629  hypothetical protein  35.59 
 
 
305 aa  41.6  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>