28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3189 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3189  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  453  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3305  hypothetical protein  87.61 
 
 
234 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3384  hypothetical protein  85.04 
 
 
233 aa  368  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1547  hypothetical protein  68.54 
 
 
246 aa  273  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03600  conserved domain protein, TIGR02271+C111  39.86 
 
 
380 aa  76.6  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.67855 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1878  hypothetical protein  40.85 
 
 
324 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340374  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  38.33 
 
 
304 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1657  hypothetical protein  44.07 
 
 
311 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.157539 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3366  hypothetical protein  42.02 
 
 
292 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4955  Domain of unknown function DUF2382-like protein  42.73 
 
 
366 aa  61.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.987311  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07780  hypothetical protein  40.18 
 
 
283 aa  60.1  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.374906 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4690  Domain of unknown function DUF2382-like protein  40.91 
 
 
301 aa  59.7  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23200  hypothetical protein  38.85 
 
 
273 aa  58.9  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.738381  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1454  hypothetical protein  28.34 
 
 
288 aa  57  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649644  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2910  PRC-barrel domain protein  41.03 
 
 
287 aa  52.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2012  PRC-barrel domain-containing protein  29.91 
 
 
282 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.621139  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1656  hypothetical protein  34.19 
 
 
281 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0172  hypothetical protein  32.46 
 
 
561 aa  49.7  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0383324  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2858  hypothetical protein  35.4 
 
 
162 aa  48.9  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.262338  normal  0.333542 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3466  PRC-barrel domain protein  38.81 
 
 
299 aa  48.5  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  hitchhiker  0.00773613 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4688  hypothetical protein  32.76 
 
 
280 aa  47.8  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0233985  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1869  hypothetical protein  37.3 
 
 
301 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4491  hypothetical protein  31.4 
 
 
266 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0823  PRC-barrel domain protein  35.96 
 
 
307 aa  46.6  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4687  hypothetical protein  33.33 
 
 
312 aa  45.1  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00986702  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3629  hypothetical protein  36.44 
 
 
305 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0277  hypothetical protein  26.81 
 
 
282 aa  42.4  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0810236  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1466  Domain of unknown function DUF2382  31.71 
 
 
291 aa  41.6  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0432048  normal  0.448786 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>