29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3466 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3466  PRC-barrel domain protein  100 
 
 		 299 aa  594  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  hitchhiker  0.00773613 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2910  PRC-barrel domain protein  53.9 
 
 		 287 aa  261  8e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4690  Domain of unknown function DUF2382-like protein  50.34 
 
 		 301 aa  234  9e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23200  hypothetical protein  46.34 
 
 		 273 aa  211  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.738381  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0823  PRC-barrel domain protein  44.03 
 
 		 307 aa  195  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07780  hypothetical protein  44.44 
 
 		 283 aa  192  6e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.374906 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1991  PRC-barrel domain protein  40 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1466  Domain of unknown function DUF2382  39.86 
 
 		 291 aa  178  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0432048  normal  0.448786 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0521  PRC-barrel domain protein  43.34 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475225 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03590  conserved domain protein, TIGR02271+C111  39.52 
 
 		 286 aa  156  4e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.692647  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2680  hypothetical protein  38.85 
 
 		 248 aa  151  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4955  Domain of unknown function DUF2382-like protein  56.16 
 
 		 366 aa  133  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.987311  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0050  Domain of unknown function DUF2382-like protein  36.3 
 
 		 301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1161  hypothetical protein  50 
 
 		 158 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000024905 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03600  conserved domain protein, TIGR02271+C111  41.67 
 
 		 380 aa  94.7  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.67855 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5727  PRC-barrel domain protein  42.31 
 
 		 145 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.310207  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3189  hypothetical protein  31.77 
 
 		 233 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1547  hypothetical protein  31.61 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3305  hypothetical protein  39.86 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3384  hypothetical protein  41.96 
 
 		 233 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0172  hypothetical protein  29.73 
 
 		 561 aa  53.5  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0888  PRC-barrel domain protein  34.95 
 
 		 295 aa  50.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1041  hypothetical protein  31.31 
 
 		 486 aa  50.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1236  hypothetical protein  34.38 
 
 		 120 aa  50.8  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.325469  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  24.91 
 
 		 304 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0824  hypothetical protein  35.78 
 
 		 117 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1869  hypothetical protein  44.07 
 
 		 301 aa  43.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2857  hypothetical protein  28.23 
 
 		 312 aa  43.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.128156  normal  0.202978 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1454  hypothetical protein  24.07 
 
 		 288 aa  42.4  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649644  normal  0.0873077 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>