18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5727 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5727  PRC-barrel domain protein  100 
 
 		 145 aa  294  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.310207  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4690  Domain of unknown function DUF2382-like protein  40.59 
 
 		 301 aa  87.8  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03590  conserved domain protein, TIGR02271+C111  41.24 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.692647  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3466  PRC-barrel domain protein  42.31 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  hitchhiker  0.00773613 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2680  hypothetical protein  35.85 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4955  Domain of unknown function DUF2382-like protein  39.6 
 
 		 366 aa  80.9  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.987311  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2910  PRC-barrel domain protein  37.5 
 
 		 287 aa  75.5  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0823  PRC-barrel domain protein  38.61 
 
 		 307 aa  75.1  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07780  hypothetical protein  35.92 
 
 		 283 aa  75.1  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.374906 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1991  PRC-barrel domain protein  43.53 
 
 		 300 aa  74.3  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1466  Domain of unknown function DUF2382  37.11 
 
 		 291 aa  73.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0432048  normal  0.448786 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1161  hypothetical protein  33.98 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000024905 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0521  PRC-barrel domain protein  41.46 
 
 		 322 aa  69.3  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475225 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03600  conserved domain protein, TIGR02271+C111  33.98 
 
 		 380 aa  68.6  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.67855 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23200  hypothetical protein  34.58 
 
 		 273 aa  66.6  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.738381  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0050  Domain of unknown function DUF2382-like protein  34.83 
 
 		 301 aa  54.3  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1236  hypothetical protein  28.28 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.325469  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0995  PRC-barrel domain-containing protein  27.62 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123984  normal  0.267939 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>