30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2680 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2680  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  483  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1466  Domain of unknown function DUF2382  41.07 
 
 		 291 aa  203  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0432048  normal  0.448786 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4690  Domain of unknown function DUF2382-like protein  40.94 
 
 		 301 aa  190  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23200  hypothetical protein  43.35 
 
 		 273 aa  187  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.738381  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0521  PRC-barrel domain protein  36.57 
 
 		 322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475225 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07780  hypothetical protein  38.04 
 
 		 283 aa  150  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.374906 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2910  PRC-barrel domain protein  38.61 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1991  PRC-barrel domain protein  29.41 
 
 		 300 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03590  conserved domain protein, TIGR02271+C111  32 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.692647  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1161  hypothetical protein  50.98 
 
 		 158 aa  112  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000024905 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4955  Domain of unknown function DUF2382-like protein  48.42 
 
 		 366 aa  112  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.987311  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0823  PRC-barrel domain protein  47.31 
 
 		 307 aa  99.4  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03600  conserved domain protein, TIGR02271+C111  43.14 
 
 		 380 aa  97.1  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.67855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3466  PRC-barrel domain protein  41.84 
 
 		 299 aa  96.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  hitchhiker  0.00773613 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0050  Domain of unknown function DUF2382-like protein  31.85 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5727  PRC-barrel domain protein  39.13 
 
 		 145 aa  81.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.310207  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1236  hypothetical protein  38.2 
 
 		 120 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.325469  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1041  hypothetical protein  31.63 
 
 		 486 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3305  hypothetical protein  27.42 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3993  hypothetical protein  35.79 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0690307  normal  0.0482358 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3189  hypothetical protein  28.57 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3384  hypothetical protein  40 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0888  PRC-barrel domain protein  29.47 
 
 		 295 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0070  hypothetical protein  30.25 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1966  hypothetical protein  25.71 
 
 		 279 aa  47  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1547  hypothetical protein  24.9 
 
 		 246 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  23.19 
 
 		 304 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1454  hypothetical protein  24.79 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649644  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2012  PRC-barrel domain-containing protein  23.9 
 
 		 282 aa  43.5  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.621139  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0172  hypothetical protein  28 
 
 		 561 aa  42.7  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0383324  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>