21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1236 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1236  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  243  4.9999999999999997e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.325469  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3993  hypothetical protein  49.15 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0690307  normal  0.0482358 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03590  conserved domain protein, TIGR02271+C111  37.74 
 
 		 286 aa  71.6  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.692647  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2680  hypothetical protein  38.2 
 
 		 248 aa  67.4  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1466  Domain of unknown function DUF2382  34.41 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0432048  normal  0.448786 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07780  hypothetical protein  32.65 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.374906 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1161  hypothetical protein  34.07 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000024905 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23200  hypothetical protein  34.83 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.738381  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3466  PRC-barrel domain protein  34.38 
 
 		 299 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  hitchhiker  0.00773613 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4690  Domain of unknown function DUF2382-like protein  33.68 
 
 		 301 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4955  Domain of unknown function DUF2382-like protein  36.78 
 
 		 366 aa  51.6  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.987311  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0823  PRC-barrel domain protein  37.08 
 
 		 307 aa  51.2  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1041  hypothetical protein  33.33 
 
 		 486 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03600  conserved domain protein, TIGR02271+C111  26.67 
 
 		 380 aa  50.4  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.67855 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2910  PRC-barrel domain protein  33.94 
 
 		 287 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5727  PRC-barrel domain protein  28.28 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.310207  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1991  PRC-barrel domain protein  31.58 
 
 		 300 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0888  PRC-barrel domain protein  32.04 
 
 		 295 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0050  Domain of unknown function DUF2382-like protein  33.73 
 
 		 301 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  29.29 
 
 		 304 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0521  PRC-barrel domain protein  37.5 
 
 		 322 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475225 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>