16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3993 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3993  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  236  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0690307  normal  0.0482358 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1236  hypothetical protein  49.15 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.325469  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07780  hypothetical protein  34.65 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.374906 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03600  conserved domain protein, TIGR02271+C111  30.63 
 
 		 380 aa  57.4  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.67855 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1466  Domain of unknown function DUF2382  34.65 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0432048  normal  0.448786 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2680  hypothetical protein  35.79 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03590  conserved domain protein, TIGR02271+C111  38.82 
 
 		 286 aa  54.3  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.692647  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23200  hypothetical protein  33.33 
 
 		 273 aa  51.6  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.738381  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4690  Domain of unknown function DUF2382-like protein  32.67 
 
 		 301 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4955  Domain of unknown function DUF2382-like protein  33.33 
 
 		 366 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.987311  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1161  hypothetical protein  31.52 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000024905 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0888  PRC-barrel domain protein  31.25 
 
 		 295 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0521  PRC-barrel domain protein  35.63 
 
 		 322 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475225 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0823  PRC-barrel domain protein  31.11 
 
 		 307 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0050  Domain of unknown function DUF2382-like protein  36.78 
 
 		 301 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1041  hypothetical protein  32.32 
 
 		 486 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>