19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0888 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0888  PRC-barrel domain protein  100 
 
 		 295 aa  545  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1041  hypothetical protein  55.47 
 
 		 486 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1991  PRC-barrel domain protein  38.18 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4690  Domain of unknown function DUF2382-like protein  35.79 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4955  Domain of unknown function DUF2382-like protein  34.44 
 
 		 366 aa  57  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.987311  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0521  PRC-barrel domain protein  40.66 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475225 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0823  PRC-barrel domain protein  33.33 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2910  PRC-barrel domain protein  37.36 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2680  hypothetical protein  29.47 
 
 		 248 aa  53.5  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03600  conserved domain protein, TIGR02271+C111  25 
 
 		 380 aa  53.1  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.67855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3466  PRC-barrel domain protein  34.95 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  hitchhiker  0.00773613 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07780  hypothetical protein  28.04 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.374906 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23200  hypothetical protein  33.68 
 
 		 273 aa  49.3  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.738381  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0050  Domain of unknown function DUF2382-like protein  38.82 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1236  hypothetical protein  32.04 
 
 		 120 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.325469  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1161  hypothetical protein  32.04 
 
 		 158 aa  47  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000024905 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1466  Domain of unknown function DUF2382  26.09 
 
 		 291 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0432048  normal  0.448786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3993  hypothetical protein  31.25 
 
 		 118 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0690307  normal  0.0482358 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03590  conserved domain protein, TIGR02271+C111  28.57 
 
 		 286 aa  42.7  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.692647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>