33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1466 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1466  Domain of unknown function DUF2382  100 
 
 		 291 aa  577  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0432048  normal  0.448786 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2680  hypothetical protein  41.95 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4690  Domain of unknown function DUF2382-like protein  41.96 
 
 		 301 aa  185  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23200  hypothetical protein  37.46 
 
 		 273 aa  158  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.738381  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07780  hypothetical protein  39.71 
 
 		 283 aa  155  9e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.374906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3466  PRC-barrel domain protein  39.86 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  hitchhiker  0.00773613 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0521  PRC-barrel domain protein  37.94 
 
 		 322 aa  151  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475225 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0823  PRC-barrel domain protein  34.62 
 
 		 307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1991  PRC-barrel domain protein  32.34 
 
 		 300 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03590  conserved domain protein, TIGR02271+C111  37.15 
 
 		 286 aa  133  3.9999999999999996e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.692647  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2910  PRC-barrel domain protein  34.41 
 
 		 287 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4955  Domain of unknown function DUF2382-like protein  48.35 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.987311  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0050  Domain of unknown function DUF2382-like protein  32.77 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03600  conserved domain protein, TIGR02271+C111  45.52 
 
 		 380 aa  94.4  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.67855 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1161  hypothetical protein  42.7 
 
 		 158 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000024905 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5727  PRC-barrel domain protein  37.11 
 
 		 145 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.310207  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  27.05 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1236  hypothetical protein  34.41 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.325469  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1878  hypothetical protein  27.43 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1454  hypothetical protein  40.82 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649644  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3993  hypothetical protein  34.65 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0690307  normal  0.0482358 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0215  hypothetical protein  34.82 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3817  hypothetical protein  34.82 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1869  hypothetical protein  35.96 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3629  hypothetical protein  35.96 
 
 		 305 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1547  hypothetical protein  31.18 
 
 		 246 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3305  hypothetical protein  34.01 
 
 		 234 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5285  hypothetical protein  27.21 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0888  PRC-barrel domain protein  26.09 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5572  hypothetical protein  27.21 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2012  PRC-barrel domain-containing protein  29.66 
 
 		 282 aa  43.5  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.621139  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0172  hypothetical protein  27.64 
 
 		 561 aa  42.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3189  hypothetical protein  31.71 
 
 		 233 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>