17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3210 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3210  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  360  6e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.743942 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6197  hypothetical protein  57.27 
 
 		 136 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.558833  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3817  hypothetical protein  37.82 
 
 		 294 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0215  hypothetical protein  36.97 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4072  hypothetical protein  33.53 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1797  hypothetical protein  39.82 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.71846  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1869  hypothetical protein  40.65 
 
 		 301 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1986  hypothetical protein  38.05 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0312653  hitchhiker  0.00472335 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3629  hypothetical protein  39.84 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0172  hypothetical protein  30.63 
 
 		 561 aa  57.8  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0738  hypothetical protein  52 
 
 		 240 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0776  hypothetical protein  39.77 
 
 		 238 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0833478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0817  hypothetical protein  41.46 
 
 		 238 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.470186 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5578  hypothetical protein  46.43 
 
 		 198 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3611  hypothetical protein  47.37 
 
 		 281 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3958  hypothetical protein  44.44 
 
 		 274 aa  41.6  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.161528 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4579  hypothetical protein  29.93 
 
 		 292 aa  41.6  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.324475 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>