53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5578 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5578  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  364  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3958  hypothetical protein  66.3 
 
 
274 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.161528 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0738  hypothetical protein  63.5 
 
 
240 aa  156  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3611  hypothetical protein  60.32 
 
 
281 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0817  hypothetical protein  63.33 
 
 
238 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.470186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0776  hypothetical protein  62.2 
 
 
238 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0833478  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4049  hypothetical protein  43.02 
 
 
183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4299  hypothetical protein  46.93 
 
 
201 aa  97.1  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0778  hypothetical protein  46.63 
 
 
198 aa  91.3  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4780  hypothetical protein  47.8 
 
 
194 aa  91.3  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242814  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4729  hypothetical protein  46.99 
 
 
204 aa  88.2  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4130  hypothetical protein  49.2 
 
 
238 aa  87.8  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.321426 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5156  hypothetical protein  48.09 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4624  hypothetical protein  43.72 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.506407 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2470  hypothetical protein  46.02 
 
 
193 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0978713  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2751  hypothetical protein  38.71 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2568  hypothetical protein  43.95 
 
 
421 aa  68.6  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.605817  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0140  hypothetical protein  38.92 
 
 
257 aa  68.2  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3817  hypothetical protein  44.93 
 
 
294 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0215  hypothetical protein  44.93 
 
 
294 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3569  hypothetical protein  37.35 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2385  hypothetical protein  31.07 
 
 
177 aa  63.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0128  hypothetical protein  33.33 
 
 
187 aa  62.8  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1181  hypothetical protein  39.86 
 
 
184 aa  62.4  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.581092  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  28.14 
 
 
190 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0145  hypothetical protein  32.35 
 
 
187 aa  62.4  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3235  hypothetical protein  28.92 
 
 
182 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0885199 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4072  hypothetical protein  44.19 
 
 
254 aa  58.9  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0172  hypothetical protein  37.66 
 
 
561 aa  58.9  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0383324  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0942  hypothetical protein  30.91 
 
 
255 aa  57.4  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.410236  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2867  hypothetical protein  30.3 
 
 
255 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4613  hypothetical protein  39.89 
 
 
185 aa  54.7  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3629  hypothetical protein  40.58 
 
 
305 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1869  hypothetical protein  40.58 
 
 
301 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5073  hypothetical protein  30.17 
 
 
197 aa  52.4  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191555  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0202  hypothetical protein  28.57 
 
 
172 aa  51.6  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4579  hypothetical protein  49.02 
 
 
292 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1797  hypothetical protein  55.77 
 
 
219 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.71846  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1986  hypothetical protein  51.92 
 
 
225 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0312653  hitchhiker  0.00472335 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3210  hypothetical protein  47.17 
 
 
183 aa  48.1  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.743942 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0262  hypothetical protein  28.22 
 
 
187 aa  47.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4757  hypothetical protein  37.7 
 
 
395 aa  44.7  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311198  normal  0.483152 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1118  hypothetical protein  41.52 
 
 
187 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0853  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  38.79 
 
 
238 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0486  hypothetical protein  33.95 
 
 
159 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0280674  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07990  hypothetical protein  36.02 
 
 
160 aa  43.9  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.744035  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0872  hypothetical protein  29.27 
 
 
201 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0005  hypothetical protein  34.09 
 
 
332 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781712  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0807  hypothetical protein  42.11 
 
 
162 aa  42.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387772 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1071  hypothetical protein  29.09 
 
 
164 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.223632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1077  hypothetical protein  30.87 
 
 
255 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2701  hypothetical protein  28.39 
 
 
169 aa  41.6  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2700  hypothetical protein  28.39 
 
 
169 aa  41.6  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>