36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2751 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2751  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  352  1e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0128  hypothetical protein  53.85 
 
 
187 aa  152  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0145  hypothetical protein  52.07 
 
 
187 aa  149  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1181  hypothetical protein  57.41 
 
 
184 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.581092  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1118  hypothetical protein  60.25 
 
 
187 aa  119  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2568  hypothetical protein  37.04 
 
 
421 aa  77.8  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.605817  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3569  hypothetical protein  39.63 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2867  hypothetical protein  35.5 
 
 
255 aa  74.3  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  36.84 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0942  hypothetical protein  33.73 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.410236  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0853  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  36.88 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2385  hypothetical protein  41.98 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3235  hypothetical protein  29.27 
 
 
182 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0885199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1077  hypothetical protein  30.12 
 
 
255 aa  61.6  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0202  hypothetical protein  31.87 
 
 
172 aa  61.6  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0140  hypothetical protein  37.04 
 
 
257 aa  60.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1454  hypothetical protein  32.73 
 
 
165 aa  57.8  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.390893  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4049  hypothetical protein  30.82 
 
 
183 aa  55.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3958  hypothetical protein  39.33 
 
 
274 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.161528 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0872  hypothetical protein  26.63 
 
 
201 aa  54.7  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3236  hypothetical protein  29.8 
 
 
163 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2068  hypothetical protein  38.89 
 
 
176 aa  53.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0134546 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0807  hypothetical protein  35.47 
 
 
162 aa  52.4  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387772 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3611  hypothetical protein  39.53 
 
 
281 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0262  hypothetical protein  28.76 
 
 
187 aa  50.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0486  hypothetical protein  36 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0280674  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5139  signal transduction histidine kinase LytS  39.35 
 
 
522 aa  48.5  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0916  hypothetical protein  32.65 
 
 
165 aa  48.1  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5578  hypothetical protein  38.71 
 
 
198 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07990  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  47.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.744035  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1054  putative permease  41.38 
 
 
201 aa  47  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0555  hypothetical protein  34.57 
 
 
183 aa  45.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.913643 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3410  hypothetical protein  33.33 
 
 
170 aa  45.1  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3824  hypothetical protein  34.57 
 
 
183 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2182  hypothetical protein  30.22 
 
 
158 aa  42  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1166  hypothetical protein  33.77 
 
 
176 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>