30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2068 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2068  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  351  2e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0134546 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0872  hypothetical protein  35.52 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2751  hypothetical protein  38.62 
 
 		 178 aa  84.7  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5711  hypothetical protein  42.59 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.491196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0128  hypothetical protein  45.1 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0145  hypothetical protein  44.16 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  33.33 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2385  hypothetical protein  32.34 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1181  hypothetical protein  42.07 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.581092  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3235  hypothetical protein  28.03 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0885199 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3569  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1077  hypothetical protein  27.71 
 
 		 255 aa  57.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4049  hypothetical protein  28.38 
 
 		 183 aa  53.9  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0140  hypothetical protein  27.89 
 
 		 257 aa  52  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0853  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  35.42 
 
 		 238 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0916  hypothetical protein  32.48 
 
 		 165 aa  50.8  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2867  hypothetical protein  25.62 
 
 		 255 aa  48.5  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0202  hypothetical protein  27.91 
 
 		 172 aa  48.1  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1454  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  48.1  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.390893  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3236  hypothetical protein  24.52 
 
 		 163 aa  47.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1118  hypothetical protein  34.15 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1054  putative permease  29.85 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2261  hypothetical protein  26.67 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0942  hypothetical protein  26.35 
 
 		 255 aa  45.8  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.410236  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2568  hypothetical protein  33.54 
 
 		 421 aa  45.1  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.605817  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5934  hypothetical protein  34.65 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.476639 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6207  hypothetical protein  34.65 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5139  signal transduction histidine kinase LytS  27.56 
 
 		 522 aa  42.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0262  hypothetical protein  25.9 
 
 		 187 aa  42.4  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0130  hypothetical protein  25.16 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.722331  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>