26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0916 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0916  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  314  3e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0145  hypothetical protein  38.31 
 
 		 187 aa  85.1  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0128  hypothetical protein  37.66 
 
 		 187 aa  85.1  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2751  hypothetical protein  32.65 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1118  hypothetical protein  41.67 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1181  hypothetical protein  36.6 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.581092  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  36.5 
 
 		 190 aa  60.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3569  hypothetical protein  33.57 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2568  hypothetical protein  37.84 
 
 		 421 aa  57  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.605817  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2068  hypothetical protein  33.12 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0134546 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0202  hypothetical protein  29.45 
 
 		 172 aa  50.8  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2385  hypothetical protein  27.95 
 
 		 177 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0430  hypothetical protein  31.88 
 
 		 266 aa  50.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4049  hypothetical protein  29.08 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2261  hypothetical protein  25.97 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0872  hypothetical protein  29.94 
 
 		 201 aa  48.9  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3235  hypothetical protein  30.12 
 
 		 182 aa  47.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0885199 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2640  hypothetical protein  29.8 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2782  hypothetical protein  29.8 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1044  hypothetical protein  30.5 
 
 		 357 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1454  hypothetical protein  36.43 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.390893  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4299  hypothetical protein  37.75 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0159  hypothetical protein  29.14 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1303  hypothetical protein  29.14 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0134  hypothetical protein  29.14 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1290  hypothetical protein  29.58 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000841188  hitchhiker  0.00412326 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>