40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0145 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0145  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0128  hypothetical protein  96.26 
 
 		 187 aa  323  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1181  hypothetical protein  67.39 
 
 		 184 aa  201  6e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.581092  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1118  hypothetical protein  69.83 
 
 		 187 aa  192  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2751  hypothetical protein  52.07 
 
 		 178 aa  160  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3569  hypothetical protein  37.65 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0853  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  37.72 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2568  hypothetical protein  36.57 
 
 		 421 aa  69.7  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.605817  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  36.76 
 
 		 190 aa  67.8  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0916  hypothetical protein  38.31 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3235  hypothetical protein  30 
 
 		 182 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0885199 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2385  hypothetical protein  39.08 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2068  hypothetical protein  42.24 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0134546 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07990  hypothetical protein  35 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.744035  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0202  hypothetical protein  29.52 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0807  hypothetical protein  38.71 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00387772 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4049  hypothetical protein  30.19 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3611  hypothetical protein  44.44 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2867  hypothetical protein  42.53 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3958  hypothetical protein  38.04 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.161528 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0872  hypothetical protein  30.19 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0942  hypothetical protein  41.38 
 
 		 255 aa  53.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.410236  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0388  hypothetical protein  31.18 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.68163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1077  hypothetical protein  30.56 
 
 		 255 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1054  putative permease  35.8 
 
 		 201 aa  51.2  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1454  hypothetical protein  31.33 
 
 		 165 aa  51.2  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.390893  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0486  hypothetical protein  36.13 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0280674  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0140  hypothetical protein  34.01 
 
 		 257 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5131  putative transmembrane protein  30.77 
 
 		 171 aa  48.9  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2874  hypothetical protein  32.54 
 
 		 232 aa  48.5  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5410  hypothetical protein  28.34 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.891019 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5578  hypothetical protein  33.53 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4299  hypothetical protein  46.58 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0130  hypothetical protein  28.47 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.722331  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0262  hypothetical protein  24.35 
 
 		 187 aa  45.4  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0738  hypothetical protein  31.92 
 
 		 240 aa  43.9  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1260  hypothetical protein  29.59 
 
 		 243 aa  42.4  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4157  hypothetical protein  31.37 
 
 		 159 aa  42  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00446593  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4729  hypothetical protein  42.05 
 
 		 204 aa  41.6  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2182  hypothetical protein  24.5 
 
 		 158 aa  41.2  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>