13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4157 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4157  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  307  4e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00446593  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0128  hypothetical protein  31.37 
 
 
187 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0145  hypothetical protein  31.37 
 
 
187 aa  54.7  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2751  hypothetical protein  30.83 
 
 
178 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3569  hypothetical protein  32.58 
 
 
157 aa  48.5  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  27.54 
 
 
190 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2385  hypothetical protein  29.76 
 
 
177 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4049  hypothetical protein  33.04 
 
 
183 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3235  hypothetical protein  31.78 
 
 
182 aa  44.3  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0885199 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2701  hypothetical protein  32.11 
 
 
169 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2700  hypothetical protein  32.11 
 
 
169 aa  43.9  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2568  hypothetical protein  38.78 
 
 
421 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.605817  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0942  hypothetical protein  26.39 
 
 
255 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.410236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>