67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4729 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4729  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5156  hypothetical protein  65.66 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4780  hypothetical protein  61.81 
 
 		 194 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242814  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4049  hypothetical protein  46.19 
 
 		 183 aa  155  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4624  hypothetical protein  66.67 
 
 		 197 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.506407 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0778  hypothetical protein  66.67 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4299  hypothetical protein  50 
 
 		 201 aa  125  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3958  hypothetical protein  50.28 
 
 		 274 aa  112  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.161528 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4130  hypothetical protein  50 
 
 		 238 aa  112  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.321426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3611  hypothetical protein  47.52 
 
 		 281 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5578  hypothetical protein  47.8 
 
 		 198 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2568  hypothetical protein  46.36 
 
 		 421 aa  85.5  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.605817  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2470  hypothetical protein  42.56 
 
 		 193 aa  85.5  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0978713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5073  hypothetical protein  33.67 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191555  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0738  hypothetical protein  40.2 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2751  hypothetical protein  37.31 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  31.37 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0853  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  37.1 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2867  hypothetical protein  34.18 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0128  hypothetical protein  40.85 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1077  hypothetical protein  38.1 
 
 		 255 aa  68.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3569  hypothetical protein  38.46 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0145  hypothetical protein  40.14 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0942  hypothetical protein  34.18 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.410236  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0202  hypothetical protein  32.3 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3235  hypothetical protein  30.3 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0885199 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0262  hypothetical protein  30.3 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0817  hypothetical protein  37.31 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.470186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0776  hypothetical protein  38.34 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0833478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2385  hypothetical protein  27.78 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0140  hypothetical protein  34.9 
 
 		 257 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1181  hypothetical protein  36.75 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.581092  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5456  hypothetical protein  31.18 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373907 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5410  hypothetical protein  30.21 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.891019 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4613  hypothetical protein  36.7 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0486  hypothetical protein  39.46 
 
 		 159 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0280674  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1167  hypothetical protein  28 
 
 		 193 aa  52  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0215  hypothetical protein  34 
 
 		 294 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3817  hypothetical protein  34 
 
 		 294 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3236  hypothetical protein  27.69 
 
 		 163 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5139  signal transduction histidine kinase LytS  35.54 
 
 		 522 aa  49.7  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07990  hypothetical protein  35 
 
 		 160 aa  49.7  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.744035  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2182  hypothetical protein  27.01 
 
 		 158 aa  48.5  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596109  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0555  hypothetical protein  31.52 
 
 		 183 aa  48.5  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.913643 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5439  hypothetical protein  29.41 
 
 		 193 aa  48.1  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.627744 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1054  putative permease  30.54 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3824  hypothetical protein  32.32 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0872  hypothetical protein  27.67 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4379  hypothetical protein  25.28 
 
 		 181 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141312  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3988  hypothetical protein  25.28 
 
 		 181 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0637  hypothetical protein  35.96 
 
 		 568 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0172  hypothetical protein  29.41 
 
 		 561 aa  45.4  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6052  hypothetical protein  29.95 
 
 		 188 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0462597 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6460  hypothetical protein  29.57 
 
 		 188 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.814057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1369  hypothetical protein  29.57 
 
 		 188 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0343752  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0665  hypothetical protein  33.62 
 
 		 154 aa  45.1  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1454  hypothetical protein  34.57 
 
 		 165 aa  44.7  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.390893  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5976  hypothetical protein  24.32 
 
 		 181 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4757  hypothetical protein  26.29 
 
 		 395 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311198  normal  0.483152 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1290  hypothetical protein  25.7 
 
 		 163 aa  43.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000841188  hitchhiker  0.00412326 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1118  hypothetical protein  39.88 
 
 		 187 aa  42.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0595  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  40 
 
 		 425 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0807  hypothetical protein  33.93 
 
 		 162 aa  42.4  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00387772 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4072  hypothetical protein  34.09 
 
 		 254 aa  42  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4579  hypothetical protein  26.37 
 
 		 292 aa  42  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1260  hypothetical protein  28.57 
 
 		 243 aa  41.6  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6432  hypothetical protein  27.38 
 
 		 169 aa  41.6  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.367117  normal  0.177925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>