40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2470 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2470  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0978713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4049  hypothetical protein  38.46 
 
 		 183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4729  hypothetical protein  43.59 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4780  hypothetical protein  45.79 
 
 		 194 aa  98.2  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242814  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5578  hypothetical protein  46.29 
 
 		 198 aa  98.2  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3958  hypothetical protein  43.18 
 
 		 274 aa  94  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.161528 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5156  hypothetical protein  38.86 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4299  hypothetical protein  44.39 
 
 		 201 aa  89.4  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4130  hypothetical protein  40.58 
 
 		 238 aa  88.2  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.321426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3611  hypothetical protein  35.87 
 
 		 281 aa  81.3  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4624  hypothetical protein  40.62 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.506407 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0778  hypothetical protein  41.03 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2751  hypothetical protein  39.13 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2568  hypothetical protein  33.76 
 
 		 421 aa  62  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.605817  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0738  hypothetical protein  38.1 
 
 		 240 aa  62  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  33.8 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3569  hypothetical protein  32.62 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0776  hypothetical protein  36.65 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0833478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2867  hypothetical protein  31.01 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0128  hypothetical protein  33.78 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0145  hypothetical protein  32.73 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1181  hypothetical protein  40.56 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.581092  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0817  hypothetical protein  46.24 
 
 		 238 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.470186 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0942  hypothetical protein  27.66 
 
 		 255 aa  53.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.410236  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2385  hypothetical protein  28.82 
 
 		 177 aa  53.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4613  hypothetical protein  38.04 
 
 		 185 aa  51.2  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1562  hypothetical protein  31.03 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.821888  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1111  hypothetical protein  31.03 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0388887  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1106  hypothetical protein  31.03 
 
 		 203 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.362385  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3034  hypothetical protein  31.03 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.591494  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0966  hypothetical protein  31.03 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.145726  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0140  hypothetical protein  30.38 
 
 		 257 aa  48.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3012  hypothetical protein  32.02 
 
 		 411 aa  48.1  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3235  hypothetical protein  41.1 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0885199 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0872  hypothetical protein  33 
 
 		 201 aa  45.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1077  hypothetical protein  28.03 
 
 		 255 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5073  hypothetical protein  28.33 
 
 		 197 aa  42  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191555  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07990  hypothetical protein  36.62 
 
 		 160 aa  41.6  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.744035  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4579  hypothetical protein  36.67 
 
 		 292 aa  41.2  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0853  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  25.41 
 
 		 238 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>