47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4130 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4130  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  469  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.321426 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4049  hypothetical protein  37.56 
 
 
183 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5156  hypothetical protein  50.96 
 
 
201 aa  128  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4729  hypothetical protein  50 
 
 
204 aa  124  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4299  hypothetical protein  46.86 
 
 
201 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3958  hypothetical protein  47.34 
 
 
274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.161528 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4780  hypothetical protein  43.75 
 
 
194 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242814  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4624  hypothetical protein  48.56 
 
 
197 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.506407 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5578  hypothetical protein  49.73 
 
 
198 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3611  hypothetical protein  44.68 
 
 
281 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0778  hypothetical protein  46.15 
 
 
198 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0738  hypothetical protein  42.31 
 
 
240 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2470  hypothetical protein  40.58 
 
 
193 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0978713  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3569  hypothetical protein  37.13 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  34.57 
 
 
190 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2751  hypothetical protein  32.76 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2568  hypothetical protein  36.31 
 
 
421 aa  72  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.605817  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0776  hypothetical protein  42.56 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0833478  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0817  hypothetical protein  47.96 
 
 
238 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.470186 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0853  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  36.59 
 
 
238 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2385  hypothetical protein  33.91 
 
 
177 aa  60.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1077  hypothetical protein  32.18 
 
 
255 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2867  hypothetical protein  30.95 
 
 
255 aa  58.5  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0145  hypothetical protein  40.19 
 
 
187 aa  57  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0128  hypothetical protein  40.19 
 
 
187 aa  56.2  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3235  hypothetical protein  29.68 
 
 
182 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0885199 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2182  hypothetical protein  28.21 
 
 
158 aa  54.7  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596109  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0140  hypothetical protein  30.06 
 
 
257 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0942  hypothetical protein  28.89 
 
 
255 aa  54.3  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.410236  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1181  hypothetical protein  38.02 
 
 
184 aa  52.4  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.581092  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0262  hypothetical protein  28.88 
 
 
187 aa  52  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0872  hypothetical protein  42.22 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1869  hypothetical protein  41.18 
 
 
301 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0486  hypothetical protein  37.72 
 
 
159 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0280674  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3629  hypothetical protein  41.18 
 
 
305 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3817  hypothetical protein  38.24 
 
 
294 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4072  hypothetical protein  31.19 
 
 
254 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0215  hypothetical protein  38.24 
 
 
294 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0807  hypothetical protein  35.96 
 
 
162 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387772 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4579  hypothetical protein  38.16 
 
 
292 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0172  hypothetical protein  32.5 
 
 
561 aa  47  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0383324  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3236  hypothetical protein  25 
 
 
163 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5139  signal transduction histidine kinase LytS  39.38 
 
 
522 aa  44.7  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07990  hypothetical protein  34.62 
 
 
160 aa  43.5  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.744035  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4613  hypothetical protein  37.04 
 
 
185 aa  43.5  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5410  hypothetical protein  28.12 
 
 
204 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.891019 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2573  hypothetical protein  49.09 
 
 
193 aa  42.4  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.276792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>