39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1181 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1181  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  362  2e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.581092  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0145  hypothetical protein  67.39 
 
 
187 aa  216  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0128  hypothetical protein  67.39 
 
 
187 aa  214  8e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1118  hypothetical protein  67.42 
 
 
187 aa  169  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2751  hypothetical protein  57.41 
 
 
178 aa  167  5e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  36.96 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0853  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  38.32 
 
 
238 aa  68.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2568  hypothetical protein  38.3 
 
 
421 aa  65.1  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.605817  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3569  hypothetical protein  33.95 
 
 
157 aa  63.2  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3235  hypothetical protein  31.03 
 
 
182 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0885199 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2385  hypothetical protein  31.1 
 
 
177 aa  63.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2867  hypothetical protein  31.36 
 
 
255 aa  61.6  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0140  hypothetical protein  38.73 
 
 
257 aa  60.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0942  hypothetical protein  30.64 
 
 
255 aa  59.7  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.410236  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0130  hypothetical protein  30.77 
 
 
184 aa  58.2  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.722331  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0916  hypothetical protein  36.6 
 
 
165 aa  57.4  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4049  hypothetical protein  29.01 
 
 
183 aa  55.5  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0202  hypothetical protein  26.35 
 
 
172 aa  54.7  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1077  hypothetical protein  31.94 
 
 
255 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2068  hypothetical protein  41.61 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0134546 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0262  hypothetical protein  28.76 
 
 
187 aa  52.4  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0486  hypothetical protein  35.53 
 
 
159 aa  52.4  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0280674  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0807  hypothetical protein  38.41 
 
 
162 aa  52.4  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387772 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0872  hypothetical protein  28.32 
 
 
201 aa  52  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3958  hypothetical protein  44.27 
 
 
274 aa  52  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.161528 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07990  hypothetical protein  36.9 
 
 
160 aa  51.2  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.744035  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5139  signal transduction histidine kinase LytS  39.76 
 
 
522 aa  50.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5578  hypothetical protein  37.06 
 
 
198 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1054  putative permease  35.87 
 
 
201 aa  50.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3611  hypothetical protein  42.22 
 
 
281 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1454  hypothetical protein  33.14 
 
 
165 aa  48.5  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.390893  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0388  hypothetical protein  29.71 
 
 
213 aa  48.5  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.68163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0637  hypothetical protein  43.11 
 
 
568 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4299  hypothetical protein  40.12 
 
 
201 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5410  hypothetical protein  33.8 
 
 
204 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.891019 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1260  hypothetical protein  29.29 
 
 
243 aa  46.2  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5131  putative transmembrane protein  27.54 
 
 
171 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4729  hypothetical protein  34.94 
 
 
204 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3410  hypothetical protein  26.86 
 
 
170 aa  42.4  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>