37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2867 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2867  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0942  hypothetical protein  85.1 
 
 
255 aa  422  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.410236  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1077  hypothetical protein  69.57 
 
 
255 aa  351  5e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0140  hypothetical protein  56.68 
 
 
257 aa  268  8e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1054  putative permease  32.94 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2751  hypothetical protein  34.91 
 
 
178 aa  77.4  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0202  hypothetical protein  29.41 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  31.01 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3235  hypothetical protein  29.8 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0885199 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3824  hypothetical protein  26.06 
 
 
183 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0555  hypothetical protein  26.58 
 
 
183 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.913643 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0262  hypothetical protein  27.97 
 
 
187 aa  65.1  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2568  hypothetical protein  29.94 
 
 
421 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.605817  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3569  hypothetical protein  25.6 
 
 
157 aa  59.3  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0130  hypothetical protein  28.4 
 
 
184 aa  58.9  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.722331  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2385  hypothetical protein  32.58 
 
 
177 aa  55.5  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3410  hypothetical protein  26.52 
 
 
170 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0128  hypothetical protein  37.72 
 
 
187 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2182  hypothetical protein  23.78 
 
 
158 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596109  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0853  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  31.25 
 
 
238 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0145  hypothetical protein  36.84 
 
 
187 aa  50.1  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2785  ChaB  34.33 
 
 
68 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.167104  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7163  hypothetical protein  33.33 
 
 
216 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal  0.0195848 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1454  hypothetical protein  32.56 
 
 
165 aa  47.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.390893  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4049  hypothetical protein  23.95 
 
 
183 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4299  hypothetical protein  36.17 
 
 
201 aa  47  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5139  signal transduction histidine kinase LytS  28.57 
 
 
522 aa  46.2  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0637  hypothetical protein  27.7 
 
 
568 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1181  hypothetical protein  37.5 
 
 
184 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.581092  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3958  hypothetical protein  32.16 
 
 
274 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.161528 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1431  hypothetical protein  31.03 
 
 
186 aa  44.3  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.766186  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1553  cation transport regulator  32 
 
 
76 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.203336 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5256  hypothetical protein  27.27 
 
 
160 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3607  ChaB  29.73 
 
 
76 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0044472  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1118  hypothetical protein  37.5 
 
 
187 aa  43.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4814  ChaB family protein  25.4 
 
 
81 aa  43.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.442759  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0872  hypothetical protein  29.9 
 
 
201 aa  43.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.579086 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>