33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_4814 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_4814  ChaB family protein  100 
 
 
81 aa  171  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.442759  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0812  ChaB  65.43 
 
 
81 aa  118  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3951  ChaB family protein  49.4 
 
 
82 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.385591  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0519  ChaB family protein  43.28 
 
 
81 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2785  ChaB  41.54 
 
 
68 aa  60.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.167104  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1369  cation transport regulator  37.33 
 
 
76 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.760537  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1907  cation transport regulator  37.33 
 
 
76 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1965  cation transport regulator  37.33 
 
 
76 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.640932 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1901  cation transport regulator  37.33 
 
 
76 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.903539  normal  0.252452 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1553  cation transport regulator  37.33 
 
 
76 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.203336 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1923  cation transport regulator  36 
 
 
76 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.41011  normal  0.0497517 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01205  hypothetical protein  36 
 
 
76 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1700  cation transport regulator  36 
 
 
76 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.692804  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01195  cation transport regulator  36 
 
 
76 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2406  cation transport regulator  36 
 
 
76 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000158278 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1325  cation transport regulator  36 
 
 
76 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.109112  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2429  ChaB family protein  36 
 
 
76 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.40977  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2331  cation transport regulator  37.33 
 
 
76 aa  53.5  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.704866  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0349  ChaB  40.28 
 
 
78 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108518 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2443  ChaB  38.16 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1384  cation transport regulator  36 
 
 
76 aa  51.6  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.886338  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0295  hypothetical protein  36.11 
 
 
78 aa  52  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.152807 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0942  hypothetical protein  31.75 
 
 
255 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.410236  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1367  cation transport regulator  36 
 
 
76 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0817532  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0461  putative cation transport regulato, ChaB  37.33 
 
 
76 aa  51.6  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0020  ChaB family protein  38.81 
 
 
68 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1848  ChaB family protein  36.11 
 
 
76 aa  49.7  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3607  ChaB  34.72 
 
 
76 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0044472  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0379  ChaB family protein  39.71 
 
 
73 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.303727  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2071  ChaB  35.38 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1077  hypothetical protein  31.15 
 
 
255 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2867  hypothetical protein  25.4 
 
 
255 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0930  ChaB family protein  37.97 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.176376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>