29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0379 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0379  ChaB family protein  100 
 
 		 73 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.303727  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0349  ChaB  77.46 
 
 		 78 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108518 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2071  ChaB  51.35 
 
 		 74 aa  78.2  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2443  ChaB  56.34 
 
 		 76 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1848  ChaB family protein  52.78 
 
 		 76 aa  72.4  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0461  putative cation transport regulato, ChaB  44.74 
 
 		 76 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3607  ChaB  47.95 
 
 		 76 aa  67.8  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0044472  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1553  cation transport regulator  50 
 
 		 76 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.203336 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0020  ChaB family protein  54.84 
 
 		 68 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1369  cation transport regulator  48.57 
 
 		 76 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.760537  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1907  cation transport regulator  48.57 
 
 		 76 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1965  cation transport regulator  48.57 
 
 		 76 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.640932 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1901  cation transport regulator  48.57 
 
 		 76 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.903539  normal  0.252452 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2429  ChaB family protein  45.71 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.40977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01205  hypothetical protein  45.71 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1700  cation transport regulator  45.71 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.692804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1923  cation transport regulator  45.71 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.41011  normal  0.0497517 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2406  cation transport regulator  45.71 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000158278 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1325  cation transport regulator  45.71 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.109112  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01195  cation transport regulator  45.71 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2331  cation transport regulator  52.86 
 
 		 76 aa  60.8  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.704866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0295  hypothetical protein  44 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.152807 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2785  ChaB  45.83 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.167104  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1384  cation transport regulator  44.29 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.886338  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1367  cation transport regulator  44.29 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0817532  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0930  ChaB family protein  43.59 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.176376  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4587  ChaB family protein  46.58 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4814  ChaB family protein  39.71 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.442759  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02480  ChaB protein  34.72 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>