20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4197 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4197  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  343  6e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.280656  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1013  hypothetical protein  73.49 
 
 
168 aa  222  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00744356 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4776  hypothetical protein  70.48 
 
 
169 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.349059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4858  hypothetical protein  66.27 
 
 
169 aa  207  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.897161 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1661  hypothetical protein  63.86 
 
 
168 aa  206  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.22596  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1634  hypothetical protein  63.86 
 
 
168 aa  206  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5080  hypothetical protein  72.29 
 
 
166 aa  201  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1502  hypothetical protein  46.95 
 
 
186 aa  165  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.396292  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3754  hypothetical protein  45.56 
 
 
174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0927  hypothetical protein  31.62 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0526  hypothetical protein  35.92 
 
 
166 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17831  hypothetical protein  35.92 
 
 
188 aa  62.4  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0841195  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05231  hypothetical protein  29.27 
 
 
188 aa  61.2  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14101  hypothetical protein  32.69 
 
 
194 aa  55.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.384929  normal  0.0377543 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1453  hypothetical protein  31.07 
 
 
188 aa  55.5  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15161  hypothetical protein  34 
 
 
188 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15411  hypothetical protein  30.1 
 
 
162 aa  51.6  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15561  hypothetical protein  30.1 
 
 
188 aa  51.6  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2151  hypothetical protein  34.04 
 
 
166 aa  49.7  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.379771  normal  0.358741 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0202  hypothetical protein  27.92 
 
 
172 aa  47.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>