14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3480 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3480  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  448  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4173  hypothetical protein  65.37 
 
 
240 aa  271  6e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  0.287297 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3327  hypothetical protein  53.18 
 
 
221 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3331  hypothetical protein  41.47 
 
 
230 aa  139  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1926  hypothetical protein  42.52 
 
 
207 aa  136  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4845  hypothetical protein  30.81 
 
 
222 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4405  hypothetical protein  33.64 
 
 
172 aa  94.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2588  hypothetical protein  29.81 
 
 
172 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.371628  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3492  hypothetical protein  28.37 
 
 
172 aa  55.8  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3337  PRC-barrel domain-containing protein  36.7 
 
 
140 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2437  CBS domain containing protein  24.88 
 
 
628 aa  43.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000875184  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2309  hypothetical protein  31.08 
 
 
277 aa  42  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.363913  normal  0.020455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2296  hypothetical protein  31.08 
 
 
277 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4536  hypothetical protein  26.94 
 
 
188 aa  41.6  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.981585  normal  0.638728 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>