13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_24560 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_24560  protein of unknown function (DUF2382)  100 
 
 
160 aa  301  2.0000000000000002e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03600  conserved domain protein, TIGR02271+C111  33.1 
 
 
380 aa  67.8  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.67855 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4955  Domain of unknown function DUF2382-like protein  34.29 
 
 
366 aa  61.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.987311  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4690  Domain of unknown function DUF2382-like protein  35.97 
 
 
301 aa  59.7  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23200  hypothetical protein  32.43 
 
 
273 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.738381  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3189  hypothetical protein  35.34 
 
 
233 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1657  hypothetical protein  35.17 
 
 
311 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.157539 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3305  hypothetical protein  34.59 
 
 
234 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1466  Domain of unknown function DUF2382  30.41 
 
 
291 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0432048  normal  0.448786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3466  PRC-barrel domain protein  29.37 
 
 
299 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  hitchhiker  0.00773613 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3384  hypothetical protein  33.83 
 
 
233 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07780  hypothetical protein  32.64 
 
 
283 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.374906 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2910  PRC-barrel domain protein  31.2 
 
 
287 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>