20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1677 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1677  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  211  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.989943  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0807  secreted protein  40.98 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2357  hypothetical protein  40.98 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1804  hypothetical protein  40.85 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.45464  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1190  hypothetical protein  37 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1937  hypothetical protein  48.98 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20896  hitchhiker  0.00316318 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13830  hypothetical protein  50 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381398  normal  0.46801 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0934  hypothetical protein  48.98 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.860281  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1316  hypothetical protein  39.39 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1041  hypothetical protein  39.47 
 
 		 486 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1296  hypothetical protein  52.17 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3221  hypothetical protein  38.57 
 
 		 113 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0124684  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0871  hypothetical protein  48.84 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272894  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3183  hypothetical protein  35.48 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105662  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3797  hypothetical protein  36.23 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00756278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3420  hypothetical protein  35.29 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal  0.271045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6840  secreted protein  34.62 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0980  hypothetical protein  48.08 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0299177  normal  0.0279283 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0767  hypothetical protein  40 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04280  hypothetical protein  52.78 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>