27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6840 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6840  secreted protein  100 
 
 		 103 aa  202  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0807  secreted protein  40.28 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3420  hypothetical protein  44.78 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal  0.271045 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0767  hypothetical protein  53.06 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1937  hypothetical protein  54.35 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20896  hitchhiker  0.00316318 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3797  hypothetical protein  41.79 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00756278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1804  hypothetical protein  50 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.45464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0871  hypothetical protein  34.52 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272894  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1190  hypothetical protein  37.14 
 
 		 101 aa  52  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3183  hypothetical protein  36.84 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105662  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04280  hypothetical protein  33.78 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2357  hypothetical protein  35.29 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0934  hypothetical protein  55.81 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.860281  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17500  hypothetical protein  36.17 
 
 		 130 aa  50.8  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0980  hypothetical protein  36.11 
 
 		 106 aa  50.4  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0299177  normal  0.0279283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6546  hypothetical protein  57.89 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0240638  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6639  hypothetical protein  55.26 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1316  hypothetical protein  42 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1041  hypothetical protein  38.33 
 
 		 486 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1677  hypothetical protein  34.62 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.989943  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3199  hypothetical protein  50 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000230213 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3221  hypothetical protein  35.21 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0124684  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0260  hypothetical protein  35.71 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13830  hypothetical protein  48.84 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381398  normal  0.46801 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26160  hypothetical protein  50 
 
 		 128 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2738  hypothetical protein  44.44 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0485  hypothetical protein  34.18 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>