More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_00390 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_00390  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  100 
 
 
543 aa  1076    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.476273 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0024  cell cycle protein  61.25 
 
 
487 aa  543  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0545169  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0026  cell cycle protein  57.69 
 
 
470 aa  510  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0028  cell cycle protein  57.93 
 
 
476 aa  507  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0018  cell cycle protein  56.81 
 
 
470 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0785065  normal  0.605241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0018  cell cycle protein  56.81 
 
 
470 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0026  cell cycle protein  56.81 
 
 
470 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.462099  hitchhiker  0.00956397 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10017  cell division protein rodA  54.91 
 
 
469 aa  490  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222067  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0809  cell cycle protein  56.8 
 
 
470 aa  482  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0080  cell cycle protein  57.86 
 
 
487 aa  481  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0038  cell cycle protein  58.48 
 
 
473 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0052  cell cycle protein  51.29 
 
 
460 aa  437  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00121731  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0137  cell cycle protein  50.33 
 
 
493 aa  427  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.882839  decreased coverage  0.000566285 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0045  cell cycle protein  54.57 
 
 
496 aa  425  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380495  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0030  cell cycle protein  55.82 
 
 
475 aa  424  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36129  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0050  cell cycle protein  51.25 
 
 
496 aa  423  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4433  cell cycle protein  50.21 
 
 
498 aa  422  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0021  cell cycle protein  54.36 
 
 
459 aa  419  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0114  cell division protein FtsW  48.3 
 
 
459 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.469585  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  51.01 
 
 
463 aa  394  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0025  cell cycle protein  49.43 
 
 
468 aa  391  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0028  cell cycle protein  49.35 
 
 
533 aa  386  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  47.4 
 
 
517 aa  383  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.545954  normal  0.347866 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0074  cell cycle protein  51.25 
 
 
457 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.206263  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6474  cell cycle protein  47.11 
 
 
529 aa  378  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0036  cell cycle protein  42.02 
 
 
659 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0023  cell cycle protein  47.15 
 
 
486 aa  371  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0023  cell cycle protein  46.35 
 
 
462 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000166651 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0173  cell cycle protein  47.87 
 
 
563 aa  368  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.821251 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0021  cell cycle protein  46.2 
 
 
496 aa  362  6e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5249  cell cycle protein  44.44 
 
 
469 aa  355  1e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168107 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0066  cell cycle protein  42.26 
 
 
517 aa  354  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00780  cell division protein RodA  49.75 
 
 
474 aa  351  2e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26960  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  46.3 
 
 
463 aa  345  2e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.538184  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0029  cell cycle protein  50.25 
 
 
494 aa  340  4e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1380  cell division membrane protein  44.12 
 
 
519 aa  315  9e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0033  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  41.96 
 
 
493 aa  302  1e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0023  cell cycle protein  41.1 
 
 
429 aa  293  7e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.05 
 
 
924 aa  280  7e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2306  cell cycle protein  39.73 
 
 
426 aa  260  6e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.186468  hitchhiker  0.000727648 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  38.66 
 
 
921 aa  259  8e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3063  FtsW/RodA/SpoVE family cell cycle protein  39.88 
 
 
480 aa  258  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00913088  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0015  cell cycle protein  40.76 
 
 
435 aa  258  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0427  cell division membrane protein  41.82 
 
 
481 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.12 
 
 
954 aa  249  7e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1712  cell cycle protein  39.8 
 
 
441 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  39.35 
 
 
933 aa  247  3e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1377  cell cycle protein  40.94 
 
 
439 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0910  cell cycle protein  37.59 
 
 
405 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.32654  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3844  cell cycle protein  38.02 
 
 
443 aa  231  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.090229  hitchhiker  0.000109873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0578  cell cycle protein  41.65 
 
 
443 aa  226  6e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.212162 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1055  cell cycle protein  33.03 
 
 
414 aa  226  8e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000372052  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1003  cell cycle protein  41.82 
 
 
444 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1306  cell cycle protein  36.26 
 
 
472 aa  220  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0044  cell cycle protein  38.21 
 
 
472 aa  216  7e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1449  cell cycle protein  37.31 
 
 
463 aa  214  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.769758  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1647  cell cycle protein  39.95 
 
 
480 aa  213  5.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393395  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3046  cell cycle protein  34.39 
 
 
422 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000270462  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0339  cell cycle protein FtsW  33.68 
 
 
409 aa  207  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3846  cell cycle protein  36.63 
 
 
428 aa  206  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.57616  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0331  cell cycle protein FtsW  33.93 
 
 
409 aa  206  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2477  cell cycle protein  33.42 
 
 
399 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0875  cell cycle protein  33.51 
 
 
422 aa  189  9e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  35.77 
 
 
972 aa  183  7e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1096  cell division protein FtsW  35.01 
 
 
420 aa  179  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3785  cell division protein FtsW  34.81 
 
 
423 aa  174  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  33.59 
 
 
368 aa  171  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  32.82 
 
 
368 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09080  stage V sporulation protein E  33.42 
 
 
365 aa  161  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.861786  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0484  cell cycle protein  29.4 
 
 
509 aa  157  4e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  32.45 
 
 
367 aa  156  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1303  cell division protein FtsW  35.56 
 
 
365 aa  155  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  33.85 
 
 
364 aa  155  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3524  cell division protein FtsW  32.08 
 
 
501 aa  150  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.336809  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2851  cell division protein FtsW  33.33 
 
 
424 aa  150  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1607  cell division protein FtsW  32.45 
 
 
396 aa  150  8e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0411  cell cycle protein  31.69 
 
 
375 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  29.46 
 
 
374 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  30.77 
 
 
371 aa  148  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3512  cell division protein FtsW  30.69 
 
 
480 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2987  cell division protein FtsW  31.47 
 
 
506 aa  145  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0447497 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3771  cell division protein FtsW  30.94 
 
 
432 aa  145  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.351351  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  32.72 
 
 
367 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3268  cell division protein FtsW  33.07 
 
 
511 aa  143  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162204  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3257  cell division protein FtsW  33.07 
 
 
511 aa  143  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19497  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3319  cell division protein FtsW  33.07 
 
 
511 aa  143  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40135  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1234  rod shape-determining protein RodA  28.46 
 
 
366 aa  142  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2113  stage V sporulation protein E  28.46 
 
 
374 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.985663  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  30.48 
 
 
380 aa  141  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3290  cell division protein FtsW  31.75 
 
 
374 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1276  stage V sporulation protein E  33.51 
 
 
374 aa  140  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  31.57 
 
 
426 aa  140  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  31.77 
 
 
378 aa  140  7.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3070  cell cycle protein FtsW  32.61 
 
 
354 aa  139  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3738  stage V sporulation protein E  35.17 
 
 
363 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29605  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3653  stage V sporulation protein E  35.17 
 
 
363 aa  139  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3670  stage V sporulation protein E  35.17 
 
 
363 aa  139  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3964  stage V sporulation protein E  35.17 
 
 
363 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261778  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4050  stage V sporulation protein E  35.17 
 
 
363 aa  139  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3926  stage V sporulation protein E  34.91 
 
 
363 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000164467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>