25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6439 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6439  putative RNA-binding protein  100 
 
 		 419 aa  792    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.351487  normal  0.0469485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0115  hypothetical protein  59.4 
 
 		 394 aa  259  6e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3731  hypothetical protein  58.55 
 
 		 364 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2727  hypothetical protein  39.22 
 
 		 280 aa  144  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.173585  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4243  hypothetical protein  43.41 
 
 		 286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.588596  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0185  hypothetical protein  39.36 
 
 		 350 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.918642  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1796  hypothetical protein  37.82 
 
 		 281 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1712  hypothetical protein  34.46 
 
 		 324 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.514921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0922  hypothetical protein  36.22 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2245  hypothetical protein  33.1 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal  0.0195881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3339  hypothetical protein  35.78 
 
 		 288 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63236 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16050  hypothetical protein  36.32 
 
 		 379 aa  99  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2547  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.33 
 
 		 251 aa  95.9  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1912  hypothetical protein  33.18 
 
 		 334 aa  92.8  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.225812  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06070  conserved hypothetical protein  27.11 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.908677  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3818  integral membrane protein  30.04 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.75139  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0792  hypothetical protein  28.94 
 
 		 260 aa  82.8  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.108595 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01465  integral membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04560)  26.47 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0667583 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5336  hypothetical protein  37.23 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0484  hypothetical protein  29.66 
 
 		 732 aa  62.8  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.676808 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08786  conserved hypothetical protein  29.79 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.616918 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  33.65 
 
 		 2397 aa  46.2  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3032  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.23 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.66002 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3258  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.23 
 
 		 340 aa  43.9  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  25.93 
 
 		 2449 aa  43.5  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>