25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1712 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1712  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  662    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.514921  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3339  hypothetical protein  46.75 
 
 
288 aa  220  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.63236 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0922  hypothetical protein  44.48 
 
 
329 aa  216  5e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2245  hypothetical protein  41.67 
 
 
399 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal  0.0195881 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1912  hypothetical protein  44.6 
 
 
334 aa  179  7e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.225812  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16050  hypothetical protein  38.79 
 
 
379 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3818  integral membrane protein  34.67 
 
 
315 aa  145  9e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.75139  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6439  putative RNA-binding protein  34.46 
 
 
419 aa  123  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.351487  normal  0.0469485 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0484  hypothetical protein  32.88 
 
 
732 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.676808 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2727  hypothetical protein  32.38 
 
 
280 aa  106  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.173585  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0792  hypothetical protein  28.63 
 
 
260 aa  95.9  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3731  hypothetical protein  34.95 
 
 
364 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0115  hypothetical protein  33.33 
 
 
394 aa  93.2  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4243  hypothetical protein  32.06 
 
 
286 aa  90.5  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.588596  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06070  conserved hypothetical protein  28.1 
 
 
377 aa  89.7  6e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.908677  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2547  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.2 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0185  hypothetical protein  28.38 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.918642  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5336  hypothetical protein  34.81 
 
 
216 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01465  integral membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04560)  26.5 
 
 
443 aa  76.6  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0667583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1796  hypothetical protein  28.48 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08786  conserved hypothetical protein  31.38 
 
 
322 aa  68.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.616918 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3258  phosphoesterase PA-phosphatase related  23.12 
 
 
340 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3032  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.73 
 
 
359 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.66002 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2273  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.06 
 
 
300 aa  46.6  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0064952  normal  0.143874 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5537  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  28.57 
 
 
348 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.353068 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>