26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1912 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1912  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  657    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.225812  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2245  hypothetical protein  76.42 
 
 		 399 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal  0.0195881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1712  hypothetical protein  41.39 
 
 		 324 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.514921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3339  hypothetical protein  41.87 
 
 		 288 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63236 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3818  integral membrane protein  43.26 
 
 		 315 aa  170  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.75139  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0922  hypothetical protein  38.74 
 
 		 329 aa  156  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16050  hypothetical protein  35.71 
 
 		 379 aa  129  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6439  putative RNA-binding protein  31.43 
 
 		 419 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.351487  normal  0.0469485 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0484  hypothetical protein  36.98 
 
 		 732 aa  101  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.676808 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0792  hypothetical protein  31.95 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06070  conserved hypothetical protein  29.18 
 
 		 377 aa  92.8  8e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.908677  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4243  hypothetical protein  34.12 
 
 		 286 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.588596  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2727  hypothetical protein  31.76 
 
 		 280 aa  86.7  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.173585  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0115  hypothetical protein  31.56 
 
 		 394 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3731  hypothetical protein  31.66 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2547  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.62 
 
 		 251 aa  82  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0185  hypothetical protein  33.01 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.918642  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1796  hypothetical protein  29.19 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01465  integral membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04560)  27.08 
 
 		 443 aa  72.8  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0667583 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08786  conserved hypothetical protein  28.7 
 
 		 322 aa  72  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.616918 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5336  hypothetical protein  29.91 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3032  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.59 
 
 		 359 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.66002 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3258  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.34 
 
 		 340 aa  54.3  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61648  predicted protein  22.16 
 
 		 438 aa  45.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.444287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5537  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  26.84 
 
 		 348 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2273  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.19 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0064952  normal  0.143874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>