23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5336 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5336  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  431  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3339  hypothetical protein  31.31 
 
 		 288 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63236 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2245  hypothetical protein  32.56 
 
 		 399 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal  0.0195881 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0922  hypothetical protein  30.66 
 
 		 329 aa  90.5  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1712  hypothetical protein  35.18 
 
 		 324 aa  89.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.514921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16050  hypothetical protein  35.43 
 
 		 379 aa  89.4  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3818  integral membrane protein  32.38 
 
 		 315 aa  88.6  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.75139  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3731  hypothetical protein  32.84 
 
 		 364 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0484  hypothetical protein  38.04 
 
 		 732 aa  86.3  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.676808 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1912  hypothetical protein  30.88 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.225812  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2547  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.55 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0115  hypothetical protein  37.97 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0185  hypothetical protein  32.16 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.918642  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2727  hypothetical protein  31.75 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.173585  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0792  hypothetical protein  28.14 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6439  putative RNA-binding protein  35.05 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.351487  normal  0.0469485 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08786  conserved hypothetical protein  33.49 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.616918 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06070  conserved hypothetical protein  27.64 
 
 		 377 aa  62  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.908677  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4243  hypothetical protein  34.2 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.588596  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1796  hypothetical protein  28.89 
 
 		 281 aa  58.5  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1527  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  26.72 
 
 		 311 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.266998 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01465  integral membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04560)  24.8 
 
 		 443 aa  53.9  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0667583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3258  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.17 
 
 		 340 aa  42.4  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>