25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3818 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3818  integral membrane protein  100 
 
 		 315 aa  612  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.75139  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1912  hypothetical protein  43.06 
 
 		 334 aa  162  6e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.225812  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2245  hypothetical protein  41.4 
 
 		 399 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal  0.0195881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1712  hypothetical protein  34.3 
 
 		 324 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.514921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3339  hypothetical protein  35.23 
 
 		 288 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.63236 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0922  hypothetical protein  35.81 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0484  hypothetical protein  34.72 
 
 		 732 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.676808 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16050  hypothetical protein  33.9 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2727  hypothetical protein  31.78 
 
 		 280 aa  98.6  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.173585  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06070  conserved hypothetical protein  29.36 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.908677  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6439  putative RNA-binding protein  30.04 
 
 		 419 aa  83.2  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.351487  normal  0.0469485 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4243  hypothetical protein  29.91 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.588596  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0792  hypothetical protein  26.7 
 
 		 260 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5336  hypothetical protein  34.64 
 
 		 216 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01465  integral membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04560)  25.4 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0667583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0115  hypothetical protein  30.14 
 
 		 394 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2547  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.57 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3731  hypothetical protein  28.86 
 
 		 364 aa  63.2  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08786  conserved hypothetical protein  26.94 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.616918 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1796  hypothetical protein  27.56 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0185  hypothetical protein  28.1 
 
 		 350 aa  49.3  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.918642  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3032  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.17 
 
 		 359 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.66002 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3258  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 340 aa  46.2  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61648  predicted protein  22.91 
 
 		 438 aa  45.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.444287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5537  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.76 
 
 		 348 aa  42.7  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.353068 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>